RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261507.10

MSMO1-201, Transcript of methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSMO1, Length 2,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1-201ENST00000261507 SYCP3Q8IZU3 236 aa15.18■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 METTL13Q8N6R0 699 aa15.18■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 PDLIM7Q9NR12 457 aa15.18■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 DMAC2Q9NW81 257 aa15.18■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa15.18■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa15.18■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 TREHO43280 583 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 TUBBP07437 444 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 TLE2Q04725 743 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 TFDP1Q14186 410 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 TRADDQ15628 312 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 STRA6Q9BX79 667 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 DNAJC12Q9UKB3 198 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 ESYT3A0FGR9 886 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 K7ENM7 598 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 EVI5O60447 810 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 B4GALT4O60513 344 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 PPP1R37O75864 691 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 CLTBP09497 229 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 ABCD1P33897 745 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 PAFAH1B1P43034 410 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 ARHGAP44Q17R89 818 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 LRRC26Q2I0M4 334 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 LINC01465Q8N7H1 131 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 SLC17A8Q8NDX2 589 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 IFT74Q96LB3 600 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 GPR88Q9GZN0 384 aa15.17■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 AGPSO00116 658 aa15.16■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 PITPNM1O00562 1244 aa15.16■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 EXOC3O60645 756 aa15.16■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 GLI1P08151 1106 aa15.16■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 PRKCIP41743 596 aa15.16■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.023e-9■■■■■ 44.4
MSMO1-201ENST00000261507 HS2ST1Q7LGA3 356 aa15.16■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 CBWD1Q9BRT8 395 aa15.16■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa15.16■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 NENFQ9UMX5 172 aa15.16■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 H0YCG3 227 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 GGCXP38435 758 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 LMAN1P49257 510 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 POU5F1BQ06416 359 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 CFAP221Q4G0U5 840 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF410Q86VK4 478 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 PALB2Q86YC2 1186 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 GLYCTKQ8IVS8 523 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 ELMO3Q96BJ8 720 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 TRPV6Q9H1D0 765 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 KCNK3O14649 394 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 FAM102BQ5T8I3 360 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 PLEKHO2Q8TD55 490 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 KRT12Q99456 494 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 TMEM39AQ9NV64 488 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 SEL1LQ9UBV2 794 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 AKT3Q9Y243 479 aa15.15■□□□□ 0.02
MSMO1-201ENST00000261507 F8VZ95 297 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 ARL2P36404 184 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 ITIH3Q06033 890 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 GPS2Q13227 327 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 MAP9Q49MG5 647 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 FAM26DQ5JW98 314 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 C8orf74Q6P047 294 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 TXLNBQ8N3L3 684 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 LRRC57Q8N9N7 239 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 OSGEPQ9NPF4 335 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 TAS2R14Q9NYV8 317 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 SQORQ9Y6N5 450 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 GOLGA8IPA6NC78 632 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 GOLGA8JA6NMD2 632 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 KIAA0355O15063 1070 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 SLC16A4O15374 487 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 MCM3P25205 808 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 RFC2P35250 354 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 SOX5P35711 763 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 STAT1P42224 750 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 CARSP49589 748 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 SMTNP53814 917 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 GALCP54803 685 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 PPP3CAQ08209 521 aa15.14■□□□□ 0.01
MSMO1-201ENST00000261507 FAAP100Q0VG06 881 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms