RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
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TOMM40-201ENST00000252487 LTBP2Q14767 1821 aa28.23■■■□□ 2.11
TOMM40-201ENST00000252487 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
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TOMM40-201ENST00000252487 SLC9A1P19634 815 aa28.22■■■□□ 2.11
TOMM40-201ENST00000252487 ENPEPQ07075 957 aa28.22■■■□□ 2.11
TOMM40-201ENST00000252487 BIRC3Q13489 604 aa28.22■■■□□ 2.11
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TOMM40-201ENST00000252487 SEMA4DQ92854 862 aa28.22■■■□□ 2.11
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TOMM40-201ENST00000252487 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
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TOMM40-201ENST00000252487 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa28.2■■■□□ 2.1
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TOMM40-201ENST00000252487 GATMP50440 423 aa28.18■■■□□ 2.1
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TOMM40-201ENST00000252487 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa28.18■■■□□ 2.1
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TOMM40-201ENST00000252487 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
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TOMM40-201ENST00000252487 PDLIM2Q96JY6 352 aa28.17■■■□□ 2.1
TOMM40-201ENST00000252487 RPS6KC1Q96S38 1066 aa28.17■■■□□ 2.1
TOMM40-201ENST00000252487 SIX2Q9NPC8 291 aa28.17■■■□□ 2.1
TOMM40-201ENST00000252487 IL23AQ9NPF7 189 aa28.17■■■□□ 2.1
TOMM40-201ENST00000252487 SIX4Q9UIU6 781 aa28.17■■■□□ 2.1
TOMM40-201ENST00000252487 CST3P01034 146 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
TOMM40-201ENST00000252487 POMCP01189 267 aa28.16■■■□□ 2.1
TOMM40-201ENST00000252487 ZBTB6Q15916 424 aa28.16■■■□□ 2.1
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