RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 NOTUMQ6P988 496 aa18.3■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 B3GNT9Q6UX72 402 aa18.3■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 SGMS1Q86VZ5 419 aa18.3■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 CEP57Q86XR8 500 aa18.3■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa18.3■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 GJA10Q969M2 543 aa18.3■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 TCEAL4Q96EI5 215 aa18.3■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 MSANTD3Q96H12 275 aa18.3■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 TEKT3Q9BXF9 490 aa18.3■□□□□ 0.52
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SPCS1-201ENST00000233025 ERLIN2O94905 339 aa18.29■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 CEACAM1P13688 526 aa18.29■□□□□ 0.52
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SPCS1-201ENST00000233025 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa18.29■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 MIER3Q7Z3K6 550 aa18.29■□□□□ 0.52
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SPCS1-201ENST00000233025 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa18.29■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 THADAQ6YHU6 1953 aa18.29■□□□□ 0.52
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SPCS1-201ENST00000233025 C1orf228Q6PIY5 440 aa18.28■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 TXNDC11Q6PKC3 985 aa18.28■□□□□ 0.52
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SPCS1-201ENST00000233025 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 SMARCD2Q92925 531 aa18.28■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM143Q96AN5 459 aa18.28■□□□□ 0.52
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SPCS1-201ENST00000233025 ZMYND12Q9H0C1 365 aa18.28■□□□□ 0.52
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SPCS1-201ENST00000233025 GPSM3Q9Y4H4 160 aa18.28■□□□□ 0.52
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SPCS1-201ENST00000233025 AKAP3O75969 853 aa18.27■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 MICAL2O94851 1124 aa18.27■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 PTPN2P17706 415 aa18.27■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 SOX9P48436 509 aa18.27■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 TUSC3Q13454 348 aa18.27■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 CCINQ13939 588 aa18.27■□□□□ 0.52
SPCS1-201ENST00000233025 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.52
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SPCS1-201ENST00000233025 ZNF263O14978 683 aa18.26■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 EXTL3O43909 919 aa18.26■□□□□ 0.51
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SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1211LQ6NV74 962 aa18.26■□□□□ 0.51
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SPCS1-201ENST00000233025 MFSD6LQ8IWD5 586 aa18.26■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 HACE1Q8IYU2 909 aa18.26■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
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SPCS1-201ENST00000233025 CORO1BQ9BR76 489 aa18.26■□□□□ 0.51
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SPCS1-201ENST00000233025 KLK14Q9P0G3 267 aa18.26■□□□□ 0.51
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SPCS1-201ENST00000233025 PLK5Q496M5 336 aa18.25■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 FERMT3Q86UX7 667 aa18.25■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 PROSER1Q86XN7 944 aa18.25■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 KLK13Q9UKR3 277 aa18.25■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 TENM4Q6N022 2769 aa18.25■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 MOSPD3O75425 235 aa18.24■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 FGFR3P22607 806 aa18.24■□□□□ 0.51
SPCS1-201ENST00000233025 CTHP32929 405 aa18.24■□□□□ 0.51
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