RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 P4HBP07237 508 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 ITIH2P19823 946 aa28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 LLGL2Q6P1M3 1020 aa28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 MAB21L3Q8N8X9 362 aa28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 ANAPC7Q9UJX3 599 aa28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 SERPINA10Q9UK55 444 aa28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 SLC8A3P57103 927 aa28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 ALCAMQ13740 583 aa28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 ASRGL1Q7L266 308 aa28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 ECHDC2Q86YB7 292 aa28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 HELQQ8TDG4 1101 aa28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 KCNV2Q8TDN2 545 aa28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 HEMGNQ9BXL5 484 aa28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 ADAM22Q9P0K1 906 aa28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.85■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 ATP5DP30049 168 aa28.84■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 ADCY8P40145 1251 aa28.84■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 LDHDQ86WU2 507 aa28.84■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 SLCO2A1Q92959 643 aa28.84■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 TMX2Q9Y320 296 aa28.84■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 MAPTP10636 758 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 MAPK4P31152 587 aa28.84■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 GTF2BQ00403 316 aa28.84■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 ACAD10Q6JQN1 1059 aa28.84■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa28.84■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 O00370 1275 aa28.83■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 CCND1P24385 295 aa28.83■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 ADSSP30520 456 aa28.83■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 FOXN2P32314 431 aa28.83■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 FAM84AQ96KN4 292 aa28.83■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 IFT74Q96LB3 600 aa28.83■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 PLVAPQ9BX97 442 aa28.83■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 KLHL14Q9P2G3 628 aa28.83■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 ANAPC5Q9UJX4 755 aa28.83■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 GRIN3BO60391 1043 aa28.83■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 KRT39Q6A163 491 aa28.83■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 IL31RAQ8NI17 732 aa28.83■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 TAS1R2Q8TE23 839 aa28.83■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 ETNK1Q9HBU6 452 aa28.83■■■□□ 2.21
FAM149A-201ENST00000227065 SCN9AQ15858 1988 aa28.83■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 ATF2P15336 505 aa28.82■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 CHURC1Q8WUH1 139 aa28.82■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM174Q8WUU8 243 aa28.82■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 ATRNL1Q5VV63 1379 aa28.82■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 TOM1O60784 492 aa28.82■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 ENTPD3O75355 529 aa28.82■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 SPOCK2Q92563 424 aa28.82■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.81■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 DHX15O43143 795 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 KRT5P13647 590 aa28.81■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM63BQ5T3F8 832 aa28.81■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 KIFC3Q9BVG8 833 aa28.81■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 USP20Q9Y2K6 914 aa28.81■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 SLX4Q8IY92 1834 aa28.81■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 SPP2Q13103 211 aa28.81■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 SLC17A8Q8NDX2 589 aa28.81■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 C7orf43Q8WVR3 580 aa28.81■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa28.81■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 COL20A1Q9P218 1284 aa28.81■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 PMM2O15305 246 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 TAC1P20366 129 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 RRM1P23921 792 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 CYP4F22Q6NT55 531 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 PARD3BQ8TEW8 1205 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 NT5C1BQ96P26 610 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 PITPNM3Q9BZ71 974 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 CCDC189A1A4V9 331 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 MAPK13O15264 365 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 SPAG7O75391 227 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 YWHABP31946 246 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 PDE6BP35913 854 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 QARSP47897 775 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 PTK6Q13882 451 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 TMED2Q15363 201 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 MAGEB18Q96M61 343 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 AGBL1Q96MI9 1066 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM237Q96Q45 408 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 SLC5A4Q9NY91 659 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 KIFAP3Q92845 792 aa28.79■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 PI4K2AQ9BTU6 479 aa28.79■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 DCLK3Q9C098 648 aa28.79■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 MTFR1Q15390 333 aa28.79■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa28.79■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 FAM102BQ5T8I3 360 aa28.79■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa28.79■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 GAS8O95995 478 aa28.78■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 ATP11AP98196 1134 aa28.78■■■□□ 2.2
FAM149A-201ENST00000227065 UGCGQ16739 394 aa28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms