RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640586.1

HADH-222, Transcript of hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, human

TSL 5

Gene HADH, Length 3,308 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HADH-222	ENST00000640586	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		10.35	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	MORC4	Q8TE76	937 aa		10.35	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	SERPINB12	Q96P63	405 aa		10.35	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	CCDC77	Q9BR77	488 aa		10.35	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	TRIM7	Q9C029	511 aa		10.35	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		10.35	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586		A8MUI8	341 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	TOM1	O60784	492 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	SP4	Q02446	784 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	KIFAP3	Q92845	792 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	SNF8	Q96H20	258 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	C9orf72	Q96LT7	481 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	ECE2	O60344	883 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	ADRB2	P07550	413 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	GZMA	P12544	262 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	CHRNB2	P17787	502 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	TMED2	Q15363	201 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	MFSD5	Q6N075	450 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	VSIG1	Q86XK7	387 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	NT5C1B	Q96P26	610 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	KCND2	Q9NZV8	630 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
HADH-222	ENST00000640586	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	TTC4	O95801	387 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	KRT16	P08779	473 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	CYP11B1	P15538	503 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	ITIH2	P19823	946 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	CDC25C	P30307	473 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	FMO1	Q01740	532 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	TRAF1	Q13077	416 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	FBF1	Q8TES7	1133 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	BICD1	Q96G01	975 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	RASA4B	C9J798	803 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	RASA4	O43374	803 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	PAX7	P23759	505 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	XKR9	Q5GH70	373 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	VSTM1	Q6UX27	236 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	PASD1	Q8IV76	773 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	SEMA4D	Q92854	862 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	WHRN	Q9P202	907 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	SORBS3	O60504	671 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	ALAS1	P13196	640 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	CRYM	Q14894	314 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	CYP1B1	Q16678	543 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	FITM2	Q8N6M3	262 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	LRRC19	Q9H756	370 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	PIK3CD	O00329	1044 aa		10.32	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	P4HA2	O15460	535 aa		10.32	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	SPAG7	O75391	227 aa		10.32	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	NPR1	P16066	1061 aa		10.32	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	MSH2	P43246	934 aa		10.32	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	MMP14	P50281	582 aa		10.32	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	STRN3	Q13033	797 aa		10.32	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	SETDB1	Q15047	1291 aa		10.32	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	KAZN	Q674X7	775 aa		10.32	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		10.32	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	LDHD	Q86WU2	507 aa		10.32	□□□□□ -0.76
HADH-222	ENST00000640586	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		10.32	□□□□□ -0.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms