RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa21.6■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 ENC1O14682 589 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 AKR1B10O60218 316 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 TUBBP07437 444 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 CTSHP09668 335 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 CDY2AQ9Y6F7 541 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 M0QZ92 97 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 FGFR4P22455 802 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 PLA2G4AP47712 749 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 TXLNBQ8N3L3 684 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 MACROD2A1Z1Q3 448 aa21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 ACKR2O00590 384 aa21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 ERLIN1O75477 346 aa21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 CHRNA1P02708 482 aa21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 NR3C1P04150 777 aa21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 NR2F2P24468 414 aa21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 LIG4P49917 911 aa21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 TRIM58Q8NG06 486 aa21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 GOLGA5Q8TBA6 731 aa21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 C11orf49Q9H6J7 331 aa21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 DUSP10Q9Y6W6 482 aa21.58■■□□□ 1.05
CLN8-208ENST00000635751 B4GALT5O43286 388 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 NOL4O94818 638 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 CD4P01730 458 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 SNX17Q15036 470 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 PNKPQ96T60 521 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 PCIF1Q9H4Z3 704 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 TACC1O75410 805 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 PIGRP01833 764 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 ADSSP30520 456 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 MGAT3Q09327 533 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 AMHR2Q16671 573 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 FAM187BQ17R55 369 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 LONRF2Q1L5Z9 754 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 SFMBT2Q5VUG0 894 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 CBWD1Q9BRT8 395 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 RHOXF2BP0C7M4 288 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 CAPN2P17655 700 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 CYP2J2P51589 502 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 HGSNATQ68CP4 663 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 ZPBP2Q6X784 338 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 RHOXF2Q9BQY4 288 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 FUT8Q9BYC5 575 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 NLRC4Q9NPP4 1024 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 PJA2O43164 708 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 SASH3O75995 380 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 ERLIN2O94905 339 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 SERPING1P05155 500 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 CKBP12277 381 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 RPL13P26373 211 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 MAGEA1P43355 309 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 NFIL3Q16649 462 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 TRIM60Q495X7 471 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 POMGNT1Q8WZA1 660 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 DMAC2Q9NW81 257 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 JRKLQ9Y4A0 524 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 TSPAN1O60635 241 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 CASP4P49662 377 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 KCNH2Q12809 1159 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms