RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 TMOD1P28289 359 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 SLC11A1P49279 550 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 PRKCEQ02156 737 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 TDGQ13569 410 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 PTPN14Q15678 1187 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 RTN1Q16799 776 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 ELOA3BQ3SY89 546 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 SIX5Q8N196 739 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 ELOA3Q8NG57 546 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 RMDN1Q96DB5 314 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 FAM167AQ96KS9 214 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 SCLT1Q96NL6 688 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 KCNK12Q9HB15 430 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 TBC1D22BQ9NU19 505 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 TBC1D13Q9NVG8 400 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 ZNF358Q9NW07 568 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 DNAJB4Q9UDY4 337 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 FBXL21Q9UKT6 434 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 CEP250Q9BV73 2442 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa9.87□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 WDR81Q562E7 1941 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 GPR179Q6PRD1 2367 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 CDC27P30260 824 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 CLCN4P51793 760 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 GIT2Q14161 759 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 NECTIN1Q15223 517 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 PRR16Q569H4 304 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 OTOP3Q7RTS5 596 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 SYT9Q86SS6 491 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 ZNF280BQ86YH2 543 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 RSAD2Q8WXG1 361 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 LENG9Q96B70 501 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 KLHL5Q96PQ7 755 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 RTP3Q9BQQ7 232 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 GBP3Q9H0R5 595 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 DACT1Q9NYF0 836 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 SAMM50Q9Y512 469 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 R4GN57 208 aa9.86□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 A0A087WZ62 844 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 TMEM150BA6NC51 233 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 GOLGA8BA8MQT2 603 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 WDR64B1ANS9 1081 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 EML1O00423 815 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 ZBTB43O43298 467 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 EDIL3O43854 480 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 OFD1O75665 1012 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 LMNAP02545 664 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 CNPP09543 421 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 CIITAP33076 1130 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 NOS2P35228 1153 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 GATA4P43694 442 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 LETM2Q2VYF4 491 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 GJA10Q969M2 543 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 CEP89Q96ST8 783 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 SH2D3AQ9BRG2 576 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 ALG2Q9H553 416 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 CHST12Q9NRB3 414 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 DISC1Q9NRI5 854 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 CACNA1BQ00975 2339 aa9.84□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.84□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 ESYT2A0FGR8 921 aa9.84□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 MSH4O15457 936 aa9.84□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 CHMP2AO43633 222 aa9.84□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 SIN3BO75182 1162 aa9.84□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 DDHD2O94830 711 aa9.84□□□□□ -0.83
TTR-204ENST00000610404 MYBP10242 640 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms