RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 KCNN1Q92952 543 aa29.45■■■□□ 2.31
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BRD4-208ENST00000597315 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
BRD4-208ENST00000597315 A0A087X0B3 334 aa29.44■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 SPDYE4A6NLX3 237 aa29.44■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 KLRC2P26717 231 aa29.44■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 MCL1Q07820 350 aa29.44■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 COASYQ13057 564 aa29.44■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 KYAT1Q16773 422 aa29.44■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa29.44■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 DHX58Q96C10 678 aa29.44■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa29.44■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP29.44■■■□□ 2.34e-7■■■■■ 66.7
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BRD4-208ENST00000597315 USP41Q3LFD5 358 aa29.43■■■□□ 2.3
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BRD4-208ENST00000597315 VN1R2Q8NFZ6 395 aa29.43■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 UROC1Q96N76 676 aa29.43■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 TNMDQ9H2S6 317 aa29.43■■■□□ 2.3
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BRD4-208ENST00000597315 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa29.42■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 F8W810 466 aa29.42■■■□□ 2.3
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BRD4-208ENST00000597315 MAP4K3Q8IVH8 894 aa29.42■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 CCDC65Q8IXS2 484 aa29.42■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 SMRP1Q8NCR6 262 aa29.42■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 HASPINQ8TF76 798 aa29.42■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 SNX27Q96L92 541 aa29.42■■■□□ 2.3
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BRD4-208ENST00000597315 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa29.42■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 PANK4Q9NVE7 773 aa29.42■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 CACNG4Q9UBN1 327 aa29.42■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 RCOR1Q9UKL0 485 aa29.42■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 PIGRP01833 764 aa29.41■■■□□ 2.3
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BRD4-208ENST00000597315 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 TAS1R1Q7RTX1 841 aa29.41■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 ZNF720Q7Z2F6 126 aa29.41■■■□□ 2.3
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BRD4-208ENST00000597315 KLHL5Q96PQ7 755 aa29.41■■■□□ 2.3
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BRD4-208ENST00000597315 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.3
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BRD4-208ENST00000597315 TBC1D7Q9P0N9 293 aa29.4■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa29.4■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 XIRP2A4UGR9 3374 aa29.39■■■□□ 2.3
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BRD4-208ENST00000597315 KIF4AO95239 1232 aa29.39■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 DSG1Q02413 1049 aa29.39■■■□□ 2.3
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BRD4-208ENST00000597315 KCNC3Q14003 757 aa29.39■■■□□ 2.3
BRD4-208ENST00000597315 XKR4Q5GH76 650 aa29.39■■■□□ 2.3
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BRD4-208ENST00000597315 KCNE1P15382 129 aa29.38■■■□□ 2.29
BRD4-208ENST00000597315 PPP2R3AQ06190 1150 aa29.38■■■□□ 2.29
BRD4-208ENST00000597315 ALCAMQ13740 583 aa29.38■■■□□ 2.29
BRD4-208ENST00000597315 E2F4Q16254 413 aa29.38■■■□□ 2.29
BRD4-208ENST00000597315 FAM171A1Q5VUB5 890 aa29.38■■■□□ 2.29
BRD4-208ENST00000597315 RESP18Q5W5W9 173 aa29.38■■■□□ 2.29
BRD4-208ENST00000597315 CES5AQ6NT32 575 aa29.38■■■□□ 2.29
BRD4-208ENST00000597315 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
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