RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAM12O43184 909 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 MED24O75448 989 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 C8AP07357 584 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 STARD6P59095 220 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 NTHL1P78549 312 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 MAPK6Q16659 721 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 PPM1LQ5SGD2 360 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 PARM1Q6UWI2 310 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf210Q8IVY1 113 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 PJA1Q8NG27 643 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNG4Q8TDN1 519 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 BSNDQ8WZ55 320 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 ADPGKQ9BRR6 497 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXQ1Q9C009 403 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 CXCL16Q9H2A7 254 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 SNTG2Q9NY99 539 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 R4GN57 208 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF292O60281 2723 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 NOTCH4Q99466 2003 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIP11Q15643 1979 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 ACKR2O00590 384 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 CCL16O15467 120 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 JAK2O60674 1132 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 EDN1P05305 212 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 PRKCBP05771 671 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 POU2F2P09086 479 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 SP9P0CG40 484 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 GLULP15104 373 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 MCM7P33993 719 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 NAMPTP43490 491 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 FOSBP53539 338 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 GPC5P78333 572 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM29Q14134 588 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 PDXDC1Q6P996 788 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 MTSS1LQ765P7 747 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 NOSTRINQ8IVI9 506 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 FGF13Q92913 245 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 SHDQ96IW2 340 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 NACC1Q96RE7 527 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC113Q9H0I3 377 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 POLIQ9UNA4 740 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 USP20Q9Y2K6 914 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 PATJQ8NI35 1801 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 COL4A3Q01955 1670 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 XYLBO75191 536 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP11B2P19099 503 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 RPA1P27694 616 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 RBM25P49756 843 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 RAB33AQ14088 237 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM132AQ24JP5 1023 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 UVSSAQ2YD98 709 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 EEF1DP3Q658K8 133 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 PADI6Q6TGC4 694 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 DEPTORQ8TB45 409 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 ITFG1Q8TB96 612 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC7A14Q8TBB6 771 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 MTRRQ9UBK8 725 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 GDAQ9Y2T3 454 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 KANSL1LA0AUZ9 987 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRN2O75325 713 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 B3GAT3O94766 335 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 LIG1P18858 919 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 FGFR3P22607 806 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 OR1D2P34982 312 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 CLCNKBP51801 687 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 PRKCQQ04759 706 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 ST3GAL1Q11201 340 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP2R5AQ15172 486 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 GLRA4Q5JXX5 417 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 RTL10Q7L3V2 364 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 NPAS3Q8IXF0 933 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 ERMNQ8TAM6 284 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 KIFC3Q9BVG8 833 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNH3Q9ULD8 1083 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 CACNA1AO00555 2505 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 OR52Z1P0C646 297 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 MUTP22033 750 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 EFNA5P52803 228 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 PFKPQ01813 784 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms