RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591662.1

CNTNAP1-204, Transcript of contactin associated protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CNTNAP1, Length 4,499 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1-204ENST00000591662 FAM102BQ5T8I3 360 aa11.65□□□□□ -0.54
CNTNAP1-204ENST00000591662 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa11.65□□□□□ -0.54
CNTNAP1-204ENST00000591662 LVRNQ6Q4G3 990 aa11.65□□□□□ -0.54
CNTNAP1-204ENST00000591662 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CNTNAP1-204ENST00000591662 SCFD2Q8WU76 684 aa11.65□□□□□ -0.54
CNTNAP1-204ENST00000591662 PCIF1Q9H4Z3 704 aa11.65□□□□□ -0.54
CNTNAP1-204ENST00000591662 TMEM260Q9NX78 707 aa11.65□□□□□ -0.54
CNTNAP1-204ENST00000591662 CCPG1Q9ULG6 757 aa11.65□□□□□ -0.54
CNTNAP1-204ENST00000591662 NEU2Q9Y3R4 380 aa11.65□□□□□ -0.54
CNTNAP1-204ENST00000591662 TACC3Q9Y6A5 838 aa11.65□□□□□ -0.54
CNTNAP1-204ENST00000591662 C5orf60A6NFR6 353 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 MTFR1Q15390 333 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 KLC3Q6P597 504 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 POTEAQ6S8J7 498 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 MIGA2Q7L4E1 593 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 C4orf33Q8N1A6 199 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 DDI1Q8WTU0 396 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 CKAP2Q8WWK9 683 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 C18orf8Q96DM3 657 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 SPC25Q9HBM1 224 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 ADAM22Q9P0K1 906 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 ZBTB5O15062 677 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 LCA5LO95447 670 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 ENO1P06733 434 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 MCF2P10911 925 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 PIK3CAP42336 1068 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 VAMP7P51809 220 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 CNGA2Q16280 664 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 HLFQ16534 295 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 QPCTQ16769 361 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 FAM81AQ8TBF8 368 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 PPP2R3CQ969Q6 453 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 KCNK16Q96T55 309 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 MANSC1Q9H8J5 431 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 SNAP23O00161 211 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 PON1P27169 355 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 PSEN1P49768 467 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 LIG4P49917 911 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 NCALDP61601 193 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 AP1B1Q10567 949 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 GRAPQ13588 217 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 ACCSLQ4AC99 568 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 OLFML2BQ68BL8 750 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 C16orf87Q6PH81 154 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 TRIM72Q6ZMU5 477 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 CATSPER2Q96P56 530 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 THTPAQ9BU02 230 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 M0QZ92 97 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 KLHL2O95198 593 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 MMP10P09238 476 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 KDSRQ06136 332 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 GRB10Q13322 594 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 GSTA3Q16772 222 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 FOXR2Q6PJQ5 311 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 RNF34Q969K3 372 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 TBC1D23Q9NUY8 699 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 TRIM33Q9UPN9 1127 aa11.64□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 RAD17O75943 681 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 KCNJ1P48048 391 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 ARSEP51690 589 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 CASP7P55210 303 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 MIIPQ5JXC2 388 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 C11orf63Q6NUN7 778 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 POTEGQ6S5H5 508 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 NT5DC3Q86UY8 548 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 KIAA0895Q8NCT3 520 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 RFC5P40937 340 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 TRIP10Q15642 601 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 P3H1Q32P28 736 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 GADL1Q6ZQY3 521 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 RFX8Q6ZV50 586 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 PARD3BQ8TEW8 1205 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 CCDC28BQ9BUN5 200 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 ACTL7BQ9Y614 415 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 P4HA2O15460 535 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 FESP07332 822 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 GCLMP48507 274 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 HSPA13P48723 471 aa11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CNTNAP1-204ENST00000591662 C12orf60Q5U649 245 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms