RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 LMO7Q8WWI1 1683 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP3K19Q56UN5 1328 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MYPNQ86TC9 1320 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 IGSF1Q8N6C5 1336 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 NFAT5O94916 1531 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA0232Q92628 1395 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 RGPD2P0DJD1 1756 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A088AWK7 358 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 USP2O75604 605 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 PRLP01236 227 aa4.91□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 H2AFB1P0C5Y9 115 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 H2AFB2P0C5Z0 115 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF853P0CG23 659 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CD96P40200 585 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 IL12RB1P42701 662 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC6A11P48066 632 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 GPSM2P81274 684 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 GRIN1Q05586 938 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF543Q08ER8 600 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 AOC3Q16853 763 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MSMPQ1L6U9 139 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 RALGPS1Q5JS13 557 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 NKAPLQ5M9Q1 402 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 TLDC1Q6P9B6 456 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM48Q8IWZ4 208 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 OXR1Q8N573 874 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM57Q8N5G2 664 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 MYCT1Q8N699 235 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 OR14C36Q8NHC7 312 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 RSAD2Q8WXG1 361 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP45Q92619 1136 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 KAT5Q92993 513 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 APIPQ96GX9 242 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 HRASLS5Q96KN8 279 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 PLCD4Q9BRC7 762 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ISCA1Q9BUE6 129 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAMTS10Q9H324 1103 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 PIM2Q9P1W9 311 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 BTBD7Q9P203 1132 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 IMPACTQ9P2X3 320 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 ACSL6Q9UKU0 697 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 VAV3Q9UKW4 847 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR52Q9Y2T5 361 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 CDY2AQ9Y6F7 541 aa4.91□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 SLIT3O75094 1523 aa4.91□□□□□ -1.62
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CAPNS1-210ENST00000590211 ALS2Q96Q42 1657 aa4.9□□□□□ -1.62
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A087WV62 115 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PQ27 194 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PQ64 194 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PQC6 194 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PQD8 194 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TCRBV5S2A0A599 114 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 GSC2O15499 205 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SGSM2O43147 1006 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 AGR2O95994 175 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 GLI4P10075 376 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 HSD3B1P14060 373 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 THBS2P35442 1172 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 RTP1P59025 263 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PPARAQ07869 468 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PRR16Q569H4 304 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SLFN12LQ6IEE8 588 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHDC10Q6PID8 442 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ASB11Q8WXH4 323 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 HDAC10Q969S8 669 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 RGMAQ96B86 450 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MPP4Q96JB8 637 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXB1Q99853 325 aa4.9□□□□□ -1.63
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CAPNS1-210ENST00000590211 ARMT1Q9H993 441 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 STARD7Q9NQZ5 370 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SCOCQ9UIL1 159 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 DENND2AQ9ULE3 1009 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 TPCN1Q9ULQ1 816 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 SIT1Q9Y3P8 196 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 ABCC4O15439 1325 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 CRB1P82279 1406 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-210ENST00000590211 RGPD5Q99666 1765 aa4.89□□□□□ -1.63
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