RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 CHRNA1P02708 482 aa28.17■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 CLTAP09496 248 aa28.17■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 STAG3L1P0CL83 205 aa28.17■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 AXLP30530 894 aa28.17■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 PTK7Q13308 1070 aa28.17■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 MTF1Q14872 753 aa28.17■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa28.17■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 NOTUMQ6P988 496 aa28.17■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 RAD9BQ6WBX8 426 aa28.17■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 KBTBD13C9JR72 458 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 M0QZ92 97 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 CCL5P13501 91 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 JAM2P57087 298 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 CDK17Q00537 523 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 SURF1Q15526 300 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 KYAT1Q16773 422 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC27A1Q6PCB7 646 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR49Q8IV35 697 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 OR5B17Q8NGF7 314 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 DEFB118Q96PH6 123 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 STARD7Q9NQZ5 370 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 MYO6Q9UM54 1294 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 DNM1LO00429 736 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 MYCP01106 439 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 CXCL8P10145 99 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM228AQ86W67 206 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 KCND1Q9NSA2 647 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 RAB20Q9NX57 234 aa28.16■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 CTSHP09668 335 aa28.15■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 OGDHLQ9ULD0 1010 aa28.15■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 B4GALT4O60513 344 aa28.14■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 RFX1P22670 979 aa28.14■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF208Q9H0X6 261 aa28.14■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 AIPL1Q9NZN9 384 aa28.14■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJC12Q9UKB3 198 aa28.14■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
SCAMP4-210ENST00000588555 IL18RAPO95256 599 aa28.14■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 VNN1O95497 513 aa28.14■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 NPTXRO95502 500 aa28.14■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 THPOP40225 353 aa28.14■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 GRM5P41594 1212 aa28.14■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 AP3M2P53677 418 aa28.14■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa28.14■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGEF19Q8IW93 802 aa28.14■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM212AQ96EL1 285 aa28.14■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 RAPGEF1Q13905 1077 aa28.13■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 SFMBT2Q5VUG0 894 aa28.13■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 HGSNATQ68CP4 663 aa28.13■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 EFCAB13Q8IY85 973 aa28.13■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 SPAG5Q96R06 1193 aa28.13■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 STK33Q9BYT3 514 aa28.13■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 SPTLC3Q9NUV7 552 aa28.13■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa28.13■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 NOD1Q9Y239 953 aa28.13■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 ARVCFO00192 962 aa28.12■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC10A6Q3KNW5 377 aa28.12■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR88Q9GZN0 384 aa28.12■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 TRPV6Q9H1D0 765 aa28.12■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 MROH7Q68CQ1 1323 aa28.12■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 USP27XA6NNY8 438 aa28.11■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 HLA-DRAP01903 254 aa28.11■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 UBXN11Q5T124 520 aa28.11■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 LACTBL1A8MY62 500 aa28.11■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 F8VZ95 297 aa28.11■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 BIRC3Q13489 604 aa28.11■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM26DQ5JW98 314 aa28.11■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 GPIHBP1Q8IV16 184 aa28.11■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 ACAP3Q96P50 834 aa28.11■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 MTMR12Q9C0I1 747 aa28.11■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 ASB7Q9H672 318 aa28.11■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 RPS6KA5O75582 802 aa28.1■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 CDK7P50613 346 aa28.1■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 DUOXA2Q1HG44 320 aa28.1■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa28.1■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 OSBPL7Q9BZF2 842 aa28.1■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
SCAMP4-210ENST00000588555 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
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