RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587623.1

CTDP1-204, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDP1, Length 435 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-204ENST00000587623 A0A0C4DFX4 3053 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 A0A087X0B3 334 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 H3BQ06 376 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 DLL1O00548 723 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 C2CD2LO14523 706 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 PIGRP01833 764 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 SOD2P04179 222 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 EDN1P05305 212 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 SLFN14P0C7P3 912 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 PROZP22891 400 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 KLRC2P26717 231 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 SYKP43405 635 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 AFMP43652 599 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 GLUD2P49448 558 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 ADAM15Q13444 863 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 CAMK1Q14012 370 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 DUSP6Q16828 381 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 USP41Q3LFD5 358 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 GLRA4Q5JXX5 417 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 LLGL2Q6P1M3 1020 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 FUT10Q6P4F1 479 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 PDXDC1Q6P996 788 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 CD302Q8IX05 232 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 STAMQ92783 540 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 CASP10Q92851 521 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 KCNN1Q92952 543 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 DNAJC19Q96DA6 116 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 TSPAN18Q96SJ8 248 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 ZBP1Q9H171 429 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 OLFML3Q9NRN5 406 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 NUB1Q9Y5A7 615 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 A0A1B0GVL5 298 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 C2orf71A6NGG8 1288 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 HIDE1A8MVS5 230 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 PTGESO14684 152 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 B3GAT3O94766 335 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 LDHAP00338 332 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 ADH1AP07327 375 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 PFKFB1P16118 471 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 RPL9P32969 192 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 COASYQ13057 564 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 CLUL1Q15846 466 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 E2F4Q16254 413 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 FAM171A1Q5VUB5 890 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 CES5AQ6NT32 575 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 UNC13DQ70J99 1090 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 HS2ST1Q7LGA3 356 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 CEP57Q86XR8 500 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 CEP120Q8N960 986 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 FSIP1Q8NA03 581 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 KIF12Q96FN5 646 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 SNX27Q96L92 541 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 C7orf25Q9BPX7 421 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 TTPALQ9BTX7 342 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 TRIM9Q9C026 710 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 EXOC1Q9NV70 894 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 CITO14578 2027 aa9.48□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 A0A0B4J269 797 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 A0A1W2PQ27 194 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 A0A1W2PQ64 194 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 A0A1W2PQD8 194 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 ARHGEF37A1IGU5 675 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 LINC01565O15544 149 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 KIF20AO95235 890 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 MYL1P05976 194 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDP1-204ENST00000587623 CXCL8P10145 99 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms