RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 ERLIN2O94905 339 aa11.64□□□□□ -0.55
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CTDNEP1-202ENST00000570380 NUP205Q92621 2012 aa11.62□□□□□ -0.55
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CTDNEP1-202ENST00000570380 RTL10Q7L3V2 364 aa11.62□□□□□ -0.55
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CTDNEP1-202ENST00000570380 HACE1Q8IYU2 909 aa11.62□□□□□ -0.55
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CTDNEP1-202ENST00000570380 CEP170P1Q96L14 293 aa11.62□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
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CTDNEP1-202ENST00000570380 EML1O00423 815 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 GIPC1O14908 333 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 ASAP2O43150 1006 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 PTPN2P17706 415 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 PSMC3P17980 439 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 SPINK2P20155 84 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
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CTDNEP1-202ENST00000570380 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 RING1Q06587 406 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 AAMPQ13685 434 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP11.61□□□□□ -0.551e-17■■■■■ 119.3
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CTDNEP1-202ENST00000570380 Q6ZS52 159 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 TCP11Q8WWU5 503 aa11.61□□□□□ -0.55
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ASB16Q96NS5 453 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 SMOC1Q9H4F8 434 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 PARP2Q9UGN5 583 aa11.61□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa11.61□□□□□ -0.55
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CTDNEP1-202ENST00000570380 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 B4GALT5O43286 388 aa11.6□□□□□ -0.55
CTDNEP1-202ENST00000570380 EPN2O95208 641 aa11.6□□□□□ -0.55
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