RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 LHX8Q68G74 356 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 SERINC5Q86VE9 423 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 CCDC42Q96M95 316 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 NT5C1BQ96P26 610 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 DESI2Q9BSY9 194 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 STK33Q9BYT3 514 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 DEF6Q9H4E7 631 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 STAG3L1P0CL83 205 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 PIK3CAP42336 1068 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 JAM2P57087 298 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 ITGA7Q13683 1181 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 ZACNQ401N2 412 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 NOTUMQ6P988 496 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 ZNF516Q92618 1163 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 WBP1LQ9NX94 342 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 PHACTR2O75167 634 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 NDUFA10O95299 355 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 PTGISQ16647 500 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 CEP120Q8N960 986 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 SEMA4DQ92854 862 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 PTPRJQ12913 1337 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 FERP16591 822 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 WDR44Q5JSH3 913 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 NOD1Q9Y239 953 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 GRIN2DO15399 1336 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 KBTBD13C9JR72 458 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 F8VZ95 297 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 NPTXRO95502 500 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 HLA-DRAP01903 254 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 CCDC172P0C7W6 258 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 CXCL8P10145 99 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 SOX5P35711 763 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 MFAP3P55082 362 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 ARID5AQ03989 594 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 RPAINQ86UA6 219 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 FAM81BQ96LP2 452 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 B4GALT4O60513 344 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 TNNC2P02585 160 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 GRM5P41594 1212 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 KRT83P78385 493 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 HGSNATQ68CP4 663 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.22■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 AKR1B10O60218 316 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 PTK7Q13308 1070 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 SPA17Q15506 151 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 TMEM192Q8IY95 271 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 FAM84AQ96KN4 292 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 ACAP3Q96P50 834 aa22.21■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms