RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
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CCNDBP1-205ENST00000564630 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM170AA1A519 330 aa21.79■■□□□ 1.08
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAPK13O15264 365 aa21.79■■□□□ 1.08
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CCNDBP1-205ENST00000564630 C11orf63Q6NUN7 778 aa21.78■■□□□ 1.08
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CCNDBP1-205ENST00000564630 DPH5Q9H2P9 285 aa21.78■■□□□ 1.08
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CCNDBP1-205ENST00000564630 FTLP02792 175 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM129AQ9BZQ8 928 aa21.78■■□□□ 1.08
CCNDBP1-205ENST00000564630 SUFUQ9UMX1 484 aa21.78■■□□□ 1.08
CCNDBP1-205ENST00000564630 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.78■■□□□ 1.08
CCNDBP1-205ENST00000564630 CYP2C8P10632 490 aa21.77■■□□□ 1.08
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CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 ITIH4Q14624 930 aa21.76■■□□□ 1.07
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CCNDBP1-205ENST00000564630 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa21.76■■□□□ 1.07
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CCNDBP1-205ENST00000564630 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 WDR46O15213 610 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 PMM2O15305 246 aa21.76■■□□□ 1.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 ALAS1P13196 640 aa21.76■■□□□ 1.07
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CCNDBP1-205ENST00000564630 GPC5P78333 572 aa21.76■■□□□ 1.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 PGM2Q96G03 612 aa21.76■■□□□ 1.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.76■■□□□ 1.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa21.75■■□□□ 1.07
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CCNDBP1-205ENST00000564630 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
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CCNDBP1-205ENST00000564630 CPXCR1Q8N123 301 aa21.75■■□□□ 1.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 HVCN1Q96D96 273 aa21.75■■□□□ 1.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 IWS1Q96ST2 819 aa21.75■■□□□ 1.07
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CCNDBP1-205ENST00000564630 HAUS2Q9NVX0 235 aa21.75■■□□□ 1.07
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