RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559551.5

RABGGTA-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 2,060 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-209ENST00000559551 PHF24Q9UPV7 400 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 P4HA2O15460 535 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 CABYRO75952 493 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 VNN1O95497 513 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 CTSHP09668 335 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 CXCL8P10145 99 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 MCF2P10911 925 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 TMEM132AQ24JP5 1023 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 RRAGAQ7L523 313 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 RPAINQ86UA6 219 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 FAM228AQ86W67 206 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 ARHGEF19Q8IW93 802 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 EFCAB13Q8IY85 973 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 CCDC112Q8NEF3 446 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 DEFB118Q96PH6 123 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 CGRRF1Q99675 332 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 GPR88Q9GZN0 384 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 TPM1P09493 284 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 CCL5P13501 91 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 JAM2P57087 298 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 ZACNQ401N2 412 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 KRT39Q6A163 491 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 VTI1AQ96AJ9 217 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 IQCDQ96DY2 449 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 GLT1D1Q96MS3 346 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 FBXL5Q9UKA1 691 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 PLAGL2Q9UPG8 496 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 STAG3L1P0CL83 205 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 GTF2H1P32780 548 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 UBXN11Q5T124 520 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 HGSNATQ68CP4 663 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 KAT5Q92993 513 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 TRPV6Q9H1D0 765 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 TRPV2Q9Y5S1 764 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 SCN1AP35498 2009 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 ARHGAP6O43182 974 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 B4GALT4O60513 344 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 TNNI1P19237 187 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 ARRDC4Q8NCT1 418 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 OGDHLQ9ULD0 1010 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 TET1Q8NFU7 2136 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 A0A0U1RQJ8 604 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 NPTXRO95502 500 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 TRAF7Q6Q0C0 670 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 ATRIPQ8WXE1 791 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 FNBP1Q96RU3 617 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 DESI2Q9BSY9 194 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 PI4K2AQ9BTU6 479 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 RNF208Q9H0X6 261 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 STARD7Q9NQZ5 370 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 APEX2Q9UBZ4 518 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 DNAJC12Q9UKB3 198 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 HES2Q9Y543 173 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-209ENST00000559551 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 LACTBL1A8MY62 500 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 THPOP40225 353 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 KCNJ6P48051 423 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 PTK7Q13308 1070 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 FBXL13Q8NEE6 735 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 TATDN2Q93075 761 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 FAM212AQ96EL1 285 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 KREMEN1Q96MU8 473 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 SPTLC3Q9NUV7 552 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 RAB20Q9NX57 234 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 SCN5AQ14524 2016 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 DNM1LO00429 736 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 HLA-DRAP01903 254 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 CLTAP09496 248 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 CDK7P50613 346 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.061e-6■■■□□ 16.1
RABGGTA-209ENST00000559551 SLC27A1Q6PCB7 646 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 WDR49Q8IV35 697 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 OLIG1Q8TAK6 271 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 HELQQ8TDG4 1101 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-209ENST00000559551 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms