RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	PARVA	Q9NVD7	372 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	RASSF10	A6NK89	507 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	TNNI1	P19237	187 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	PTPN7	P35236	360 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	CPT1A	P50416	773 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	MYO1E	Q12965	1108 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	SPC25	Q9HBM1	224 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	ARID2	Q68CP9	1835 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	CYP2C8	P10632	490 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	TSHR	P16473	764 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	MTA1	Q13330	715 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	HES6	Q96HZ4	224 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	GDF3	Q9NR23	364 aa		9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	9.1	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	CCNE2	O96020	404 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	CD4	P01730	458 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	ZACN	Q401N2	412 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	ANO5	Q75V66	913 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	COG1	Q8WTW3	980 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	SLCO2A1	Q92959	643 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	SPATA33	Q96N06	139 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	C2CD2	Q9Y426	696 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667		A0A0B4J269	797 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	CAND2	O75155	1236 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	ERCC3	P19447	782 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	SLC9A1	P19634	815 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	DGKD	Q16760	1214 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	ARMC3	Q5W041	872 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	DAW1	Q8N136	415 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	WNK4	Q96J92	1243 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF560	Q96MR9	790 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	LHX5	Q9H2C1	402 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	PHF2	O75151	1096 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	RSPH10B	P0C881	870 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	HOXD13	P35453	343 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	GALC	P54803	685 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	NR1H3	Q13133	447 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	CUL2	Q13617	745 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		9.09	□□□□□ -0.95
RBM23-233	ENST00000557667	MYH11	P35749	1972 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	ELP3	Q9H9T3	547 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF487	B1APH4	448 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667		M0QZ92	97 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	KRIT1	O00522	736 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	CYP3A5	P20815	502 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	SLC8A3	P57103	927 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	UBXN2A	P68543	259 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	CALCOCO2	Q13137	446 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		9.08	□□□□□ -0.96
RBM23-233	ENST00000557667	OPTN	Q96CV9	577 aa		9.08	□□□□□ -0.96

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