RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 TNNI1P19237 187 aa22.73■■□□□ 1.23
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TMEM260-216ENST00000557657 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.73■■□□□ 1.23
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TMEM260-216ENST00000557657 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.73■■□□□ 1.23
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TMEM260-216ENST00000557657 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.71■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.71■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.71■■□□□ 1.23
TMEM260-216ENST00000557657 MTA2O94776 668 aa22.71■■□□□ 1.23
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TMEM260-216ENST00000557657 SLCO1A2P46721 670 aa22.69■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
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TMEM260-216ENST00000557657 MYPNQ86TC9 1320 aa22.69■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.69■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 SCP2P22307 547 aa22.69■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 GLRA2P23416 452 aa22.69■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 MAPK4P31152 587 aa22.69■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.69■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 DCAF15Q66K64 600 aa22.69■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.69■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.69■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
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