RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556956.1

SLIRP-208, Transcript of SRA stem-loop interacting RNA binding protein, human

TSL 2

Gene SLIRP, Length 450 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLIRP-208	ENST00000556956	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SLIRP-208	ENST00000556956	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLIRP-208	ENST00000556956	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLIRP-208	ENST00000556956	FLT4	P35916	1363 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLIRP-208	ENST00000556956	KDR	P35968	1356 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLIRP-208	ENST00000556956	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SLIRP-208	ENST00000556956	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		3.21	□□□□□ -1.89
SLIRP-208	ENST00000556956	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	CPS1	P31327	1500 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956		A0A087WWV3	80 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	TMEM232	C9JQI7	657 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956		E7EWF7	191 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	GRM8	O00222	908 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	CPLX1	O14810	134 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	OPA1	O60313	960 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	CYP21A2	P08686	494 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	CCDC172	P0C7W6	258 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	ATP1A3	P13637	1013 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	NAT1	P18440	290 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	MAP2K2	P36507	400 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	PPP2R2A	P63151	447 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	GUCY1B3	Q02153	619 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	TEF	Q10587	303 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	TRDN	Q13061	729 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	PPFIA1	Q13136	1202 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	STIM1	Q13586	685 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	TRIM29	Q14134	588 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	TRIM14	Q14142	442 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	RESP18	Q5W5W9	173 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	STEAP3	Q658P3	488 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	MBLAC2	Q68D91	279 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	WDR93	Q6P2C0	686 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	BORA	Q6PGQ7	559 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	MIB1	Q86YT6	1006 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	CNGA4	Q8IV77	575 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	PALM2	Q8IXS6	379 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956		Q8N1Y9	231 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	GPATCH11	Q8N954	259 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	TC2N	Q8N9U0	490 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	RUBCN	Q92622	972 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	DPF2	Q92785	391 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	SUCLG2	Q96I99	432 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	NBPF4	Q96M43	638 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	WRNIP1	Q96S55	665 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	KLC2	Q9H0B6	622 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	EPC1	Q9H2F5	836 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	DONSON	Q9NYP3	566 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	RAI14	Q9P0K7	980 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	MYO6	Q9UM54	1294 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	HPSE	Q9Y251	543 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	CEP83	Q9Y592	693 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SLIRP-208	ENST00000556956		A0A1W2PQU0	124 aa		3.2	□□□□□ -1.9

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