RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 PTENP60484 403 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 FAM189BP81408 668 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 MTMR3Q13615 1198 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CAPSQ13938 189 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 TFDP1Q14186 410 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 BECN1Q14457 450 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 SLC39A14Q15043 492 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 KARSQ15046 597 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 STK38Q15208 465 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 LONRF3Q496Y0 759 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 USP49Q70CQ1 688 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 NPAS4Q8IUM7 802 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 RNF169Q8NCN4 708 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 MCPH1Q8NEM0 835 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 RASSF8Q8NHQ8 419 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CALML4Q96GE6 196 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 EPSTI1Q96J88 318 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 AK8Q96MA6 479 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 MFSD1Q9H3U5 465 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 SMOC2Q9H3U7 446 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 C1orf112Q9NSG2 853 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 WASF2Q9Y6W5 498 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 MYO10Q9HD67 2058 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CEP250Q9BV73 2442 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 SFI1A8K8P3 1242 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 FGFR1P11362 822 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 LIG1P18858 919 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 KCNMA1Q12791 1236 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 NAALADL2Q58DX5 795 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 HYIQ5T013 277 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 RINT1Q6NUQ1 792 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 TRIM46Q7Z4K8 759 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 ECHDC2Q86YB7 292 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 UBALD2Q8IYN6 164 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 KIAA2013Q8IYS2 634 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 KCNG4Q8TDN1 519 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 BSNDQ8WZ55 320 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CPB2Q96IY4 423 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 RUSC1Q9BVN2 902 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 PANK2Q9BZ23 570 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 NT5C3AQ9H0P0 336 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CHST12Q9NRB3 414 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 SORCS3Q9UPU3 1222 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 ACACBO00763 2458 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 A0A0U1RQF3 1178 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 TBKBP1A7MCY6 615 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 SPTLC2O15270 562 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 HIP1RO75146 1068 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 ERLIN2O94905 339 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 PLA2G4BP0C869 781 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 PLCG1P19174 1290 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 NASPP49321 788 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 POU5F1BQ06416 359 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 TMEM119Q4V9L6 283 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 C1orf186Q6ZWK4 172 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 LINC00301Q8NCQ3 95 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 LRRC15Q8TF66 581 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 LPPQ93052 612 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CHAMP1Q96JM3 812 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CCSER1Q9C0I3 900 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 TMEM161AQ9NX61 479 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 DACT1Q9NYF0 836 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CDH22Q9UJ99 828 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 USP20Q9Y2K6 914 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 ZDHHC9Q9Y397 364 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 ARID2Q68CP9 1835 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CCDC169A6NNP5 214 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 B4GALT5O43286 388 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 TSPAN1O60635 241 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 SRGAP2BP0DMP2 458 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 SLC12A3P55017 1021 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 PEX3P56589 373 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 MBTD1Q05BQ5 628 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 DUSP6Q16828 381 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 LLGL2Q6P1M3 1020 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 FLCNQ8NFG4 579 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 DEPTORQ8TB45 409 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 KIFAP3Q92845 792 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-217ENST00000550044 IFT74Q96LB3 600 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms