RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 TISP43B9A030 160 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 KLRC4O43908 158 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 CLTAP09496 248 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 TCF25Q9BQ70 676 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM206Q9H813 350 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 CNTN3Q9P232 1028 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.75■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 CXCL8P10145 99 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNE1P15382 129 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 TNFSF9P41273 254 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 VN1R3Q9BXE9 311 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBP1Q9H171 429 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 STK39Q9UEW8 545 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 UBE4BO95155 1302 aa20.74■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 ADSSP30520 456 aa20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 POSTNQ15063 836 aa20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 PLPP4Q5VZY2 271 aa20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 TMC7Q7Z402 723 aa20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 VPS52Q8N1B4 723 aa20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 EXOC1Q9NV70 894 aa20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 TTC26A0AVF1 554 aa20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 F8W810 466 aa20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 PRR29P0C7W0 189 aa20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 HYAL1Q12794 435 aa20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 THEGQ9P2T0 379 aa20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 PLXNA3P51805 1871 aa20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 EFEMP2O95967 443 aa20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 CTSAP10619 480 aa20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 GARTP22102 1010 aa20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 HOXD13P35453 343 aa20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 DPYDQ12882 1025 aa20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 COL19A1Q14993 1142 aa20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 KANK3Q6NY19 840 aa20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 RABGGTAQ92696 567 aa20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 UROC1Q96N76 676 aa20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 COG5Q9UP83 839 aa20.71■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 NCK2O43639 380 aa20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3-208ENST00000531226 SOD2P04179 222 aa20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3-208ENST00000531226 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3-208ENST00000531226 ADRB2P07550 413 aa20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3-208ENST00000531226 ACOT2P49753 483 aa20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3-208ENST00000531226 PSMD2Q13200 908 aa20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3-208ENST00000531226 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.7■□□□□ 0.9
PACSIN3-208ENST00000531226 FUT10Q6P4F1 479 aa20.7■□□□□ 0.9
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