RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518468.1

RB1CC1-205, Transcript of RB1 inducible coiled-coil 1, human

TSL 3

Gene RB1CC1, Length 507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RB1CC1-205	ENST00000518468	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	CSRNP2	Q9H175	543 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	TLR9	Q9NR96	1032 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	TPP1	O14773	563 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	ANTXR2	P58335	489 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	ERVK-21	P61565	698 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	ADAM8	P78325	824 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	HHEX	Q03014	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	KLF10	Q13118	480 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	ADAM15	Q13444	863 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	RIN1	Q13671	783 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	EPHA7	Q15375	998 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	DGKD	Q16760	1214 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	HYI	Q5T013	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	C2orf78	A6NCI8	922 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	CYP27B1	O15528	508 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	TYRP1	P17643	537 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	RRM1	P23921	792 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	LSP1	P33241	339 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	RGS3	P49796	1198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	NUCB1	Q02818	461 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	BTK	Q06187	659 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	GALE	Q14376	348 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	ODF1	Q14990	250 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	TTC38	Q5R3I4	469 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	BROX	Q5VW32	411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	D2HGDH	Q8N465	521 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468		K7ESF4	209 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	SNX2	O60749	519 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	PEX11B	O96011	259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	C1S	P09871	688 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	RBP3	P10745	1247 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	SLC9A1	P19634	815 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	BCAR1	P56945	870 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RB1CC1-205	ENST00000518468	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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