RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 DENND1CQ8IV53 801 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 C3orf20Q8ND61 904 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 IFI44Q8TCB0 444 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 ST8SIA2Q92186 375 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM167AQ96KS9 214 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 C20orf173Q96LM9 149 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 KCNH6Q9H252 994 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 K7ESM1 405 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 RAP2AP10114 183 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 SYN1P17600 705 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 PCSK1P29120 753 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 ALDH1A3P47895 512 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 TLE1Q04724 770 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 PLP2Q04941 152 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 C14orf80Q86SX3 495 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 Q8TCH9 128 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 VSTM5A8MXK1 200 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 ATP5JP18859 108 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 FPR1P21462 350 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 MGAT1P26572 445 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 HK3P52790 923 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 CLRN1P58418 232 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 CREMQ03060 361 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 NOGQ13253 232 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 GBX1Q14549 363 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 DACT2Q5SW24 774 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 STON2Q8WXE9 905 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 EDAQ92838 391 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 MRI1Q9BV20 369 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 CAPN14A8MX76 684 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 SELENOPP49908 381 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 MAP2K6P52564 334 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 ICAM4Q14773 271 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 TFAP2CQ92754 450 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 RAB24Q969Q5 203 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 LOXL4Q96JB6 756 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 CD248Q9HCU0 757 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 OBP2AQ9NY56 170 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 JAG2Q9Y219 1238 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM227AF5H4B4 570 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 ALDH2P05091 517 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 ALAS1P13196 640 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 MALP21145 153 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 SMARCA1P28370 1054 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCDC157Q569K6 752 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 Q6ZSN1 163 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 DGKHQ86XP1 1220 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 CHST13Q8NET6 341 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 DEF6Q9H4E7 631 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 WDCPQ9H6R7 721 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-334P-201ENST00000517072 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-334P-201ENST00000517072 WNT10BO00744 389 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-334P-201ENST00000517072 UBXN7O94888 489 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms