RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 THP07101 528 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 GALTP07902 379 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 CLTAP09496 248 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 ADSSP30520 456 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 DSC1Q08554 894 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 KYAT1Q16773 422 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 COLGALT2Q8IYK4 626 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 SAAL1Q96ER3 474 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 CBWD1Q9BRT8 395 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.58■■□□□ 1.05
HLA-B-255ENST00000498007 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 ACOT2P49753 483 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 PPP2R3AQ06190 1150 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 TUSC3Q13454 348 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 PTPROQ16827 1216 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 BMT2Q1RMZ1 405 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 POF1BQ8WVV4 589 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 SMARCE1Q969G3 411 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 FAM212AQ96EL1 285 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM169Q96HH4 297 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 PCIF1Q9H4Z3 704 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 CNTN3Q9P232 1028 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 MTCH2Q9Y6C9 303 aa21.57■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 NRP1O14786 923 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 SMC2O95347 1197 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 GARTP22102 1010 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 DNAJB1P25685 340 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 KCNB1Q14721 858 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 SLC10A6Q3KNW5 377 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 SPPL3Q8TCT6 385 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 RABGGTAQ92696 567 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 FAM213AQ9BRX8 229 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 RMND1Q9NWS8 449 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.56■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 CARNS1A5YM72 827 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 ALDH2P05091 517 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 PLCB3Q01970 1234 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 KRT17Q04695 432 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 SPAG1Q07617 926 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 NAB2Q15742 525 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 XKR4Q5GH76 650 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 ALKAL1Q6UXT8 129 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 HS2ST1Q7LGA3 356 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 PPM1EQ8WY54 764 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 IGSF21Q96ID5 467 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 LMAN2LQ9H0V9 348 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 ANK1P16157 1881 aa21.55■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 F8W810 466 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 CLIC2O15247 247 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 TGFB1I1O43294 461 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 KCNE1P15382 129 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 MARCH5Q9NX47 278 aa21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 REV3LO60673 3130 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 TTC26A0AVF1 554 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 LACTBL1A8MY62 500 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 CYP2J2P51589 502 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 UBE3AQ05086 875 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 HASPINQ8TF76 798 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 KIF12Q96FN5 646 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 GSDMAQ96QA5 445 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 TLR9Q9NR96 1032 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 SLC38A7Q9NVC3 462 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 HSPBP1Q9NZL4 362 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 LMCD1Q9NZU5 365 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.53■■□□□ 1.04
HLA-B-255ENST00000498007 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms