RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	C2CD2L	O14523	706 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB43	O43298	467 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	CHMP2A	O43633	222 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	DNM2	P50570	870 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKCE	Q02156	737 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	PGBD4	Q96DM1	585 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	PIDD1	Q9HB75	910 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	DISC1	Q9NRI5	854 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	WNT16	Q9UBV4	365 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	DPP7	Q9UHL4	492 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC27A2	O14975	620 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	UROD	P06132	367 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP3A4	P08684	503 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	MYB	P10242	640 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP2K3	P46734	347 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC11A1	P49279	550 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB27A	P51159	221 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	CLCN4	P51793	760 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	AK2	P54819	239 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC42EP1	Q00587	391 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	APOA5	Q6Q788	366 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	RUBCN	Q92622	972 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf50	Q9HD87	102 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087WZ62	844 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	KRBA1	A5PL33	1030 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	ALDH2	P05091	517 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	MTERF2	Q49AM1	385 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	NLRP4	Q96MN2	994 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	EVPL	Q92817	2033 aa		12.15	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	CLUH	O75153	1309 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	INPPL1	O15357	1258 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	BNIP3L	O60238	219 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF862	O60290	1169 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	GAS7	O60861	476 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	OFD1	O75665	1012 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	GLUD1	P00367	558 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SRF	P11831	508 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	JAK3	P52333	1124 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	FGD1	P98174	961 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR152	Q8TDT2	470 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	NXPE3	Q969Y0	559 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	NCDN	Q9UBB6	729 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SP9	P0CG40	484 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	GNA11	P29992	359 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SFN	P31947	248 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1G1	P47890	313 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	DRP2	Q13474	957 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	HIF1A	Q16665	826 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	UGCG	Q16739	394 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		12.13	□□□□□ -0.47

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