RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494398.5

CERKL-213, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 2

Gene CERKL, Length 2,391 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-213ENST00000494398 GRIN3BO60391 1043 aa22.89■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 ABCD1P33897 745 aa22.89■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 PTGIRP43119 386 aa22.89■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 ENPEPQ07075 957 aa22.89■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 CPNE8Q86YQ8 564 aa22.89■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.89■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 FNBP1Q96RU3 617 aa22.89■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.89■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.89■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 ATP2A1O14983 1001 aa22.88■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 EXTL3O43909 919 aa22.88■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 RWDD2BP57060 319 aa22.88■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.88■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.88■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 FAM84AQ96KN4 292 aa22.88■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 FAM81BQ96LP2 452 aa22.88■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 TNNI1P19237 187 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 STRN3Q13033 797 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 KRT71Q3SY84 523 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 WDR44Q5JSH3 913 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 AGBL2Q5U5Z8 902 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 ZNF516Q92618 1163 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 FAM107BQ9H098 131 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 TTC27Q6P3X3 843 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa22.86■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 CALCAP01258 141 aa22.86■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 EMC2Q15006 297 aa22.86■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 PTGISQ16647 500 aa22.86■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 TMEM143Q96AN5 459 aa22.86■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 PMS2P54278 862 aa22.86■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 SP2Q02086 613 aa22.86■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.86■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 MAPK4P31152 587 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 GBP1P32455 592 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 PLVAPQ9BX97 442 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 PARP2Q9UGN5 583 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 RARAP10276 462 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 SCP2P22307 547 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 RPL21P46778 160 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 ACOT2P49753 483 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 PSMD6Q15008 389 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 STXBP2Q15833 593 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 CYP1B1Q16678 543 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 ZNF302Q9NR11 478 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.85■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 FZD9O00144 591 aa22.84■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 COILP38432 576 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 MAGEA9P43362 315 aa22.84■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 CLDN10P78369 228 aa22.84■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 KLRG1Q96E93 195 aa22.84■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 RUNDC3BQ96NL0 473 aa22.84■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 UNGP13051 313 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 SEC24CP53992 1094 aa22.84■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 PPP2R2AP63151 447 aa22.84■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 PPARDQ03181 441 aa22.84■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 ZACNQ401N2 412 aa22.84■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.84■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 DOCK1Q14185 1865 aa22.83■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.83■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 K7ERI5 159 aa22.83■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 HLA-DRAP01903 254 aa22.83■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 PIK3CAP42336 1068 aa22.83■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 BPIFB4P59827 614 aa22.83■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 MCOLN2Q8IZK6 566 aa22.83■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 DEPTORQ8TB45 409 aa22.83■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CERKL-213ENST00000494398 E7EVH7 732 aa22.83■■□□□ 1.24
CERKL-213ENST00000494398 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms