RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490673.5

OPN3-206, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,816 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-206ENST00000490673 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
OPN3-206ENST00000490673 PPM1AP35813 382 aa25.22■■□□□ 1.63
OPN3-206ENST00000490673 GLRA4Q5JXX5 417 aa25.22■■□□□ 1.63
OPN3-206ENST00000490673 SYCP3Q8IZU3 236 aa25.22■■□□□ 1.63
OPN3-206ENST00000490673 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
OPN3-206ENST00000490673 IGSF21Q96ID5 467 aa25.22■■□□□ 1.63
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OPN3-206ENST00000490673 CLTAP09496 248 aa25.21■■□□□ 1.63
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OPN3-206ENST00000490673 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
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OPN3-206ENST00000490673 MARCH5Q9NX47 278 aa25.19■■□□□ 1.62
OPN3-206ENST00000490673 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
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OPN3-206ENST00000490673 TMEM169Q96HH4 297 aa25.19■■□□□ 1.62
OPN3-206ENST00000490673 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa25.19■■□□□ 1.62
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OPN3-206ENST00000490673 ADRB2P07550 413 aa25.18■■□□□ 1.62
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OPN3-206ENST00000490673 VN1R3Q9BXE9 311 aa25.18■■□□□ 1.62
OPN3-206ENST00000490673 CASTOR2A6NHX0 329 aa25.17■■□□□ 1.62
OPN3-206ENST00000490673 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
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OPN3-206ENST00000490673 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
OPN3-206ENST00000490673 SPATA20Q8TB22 786 aa25.17■■□□□ 1.62
OPN3-206ENST00000490673 PCIF1Q9H4Z3 704 aa25.17■■□□□ 1.62
OPN3-206ENST00000490673 TLR9Q9NR96 1032 aa25.17■■□□□ 1.62
OPN3-206ENST00000490673 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa25.17■■□□□ 1.62
OPN3-206ENST00000490673 CITO14578 2027 aa25.17■■□□□ 1.62
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OPN3-206ENST00000490673 SPAG1Q07617 926 aa25.16■■□□□ 1.62
OPN3-206ENST00000490673 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
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OPN3-206ENST00000490673 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa25.16■■□□□ 1.62
OPN3-206ENST00000490673 UBE4BO95155 1302 aa25.16■■□□□ 1.62
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OPN3-206ENST00000490673 KINO60870 393 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
OPN3-206ENST00000490673 ZBTB6Q15916 424 aa25.15■■□□□ 1.62
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OPN3-206ENST00000490673 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa25.15■■□□□ 1.62
OPN3-206ENST00000490673 FSCN2O14926 492 aa25.14■■□□□ 1.62
OPN3-206ENST00000490673 CLCNKBP51801 687 aa25.14■■□□□ 1.62
OPN3-206ENST00000490673 TCEAL5Q5H9L2 206 aa25.14■■□□□ 1.62
OPN3-206ENST00000490673 ARMCX5Q6P1M9 558 aa25.14■■□□□ 1.62
OPN3-206ENST00000490673 VPS52Q8N1B4 723 aa25.14■■□□□ 1.62
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