RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489909.1

MCCC1-208, Transcript of methylcrotonoyl-CoA carboxylase 1, human

TSL 3

Gene MCCC1, Length 458 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MCCC1-208	ENST00000489909	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	MYOC	Q99972	504 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	CAND2	O75155	1236 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	ZBED1	O96006	694 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	HRG	P04196	525 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	SBK3	P0C264	359 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	TRIM27	P14373	513 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	RHCE	P18577	417 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	MAL	P21145	153 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	IL12RB1	P42701	662 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	NPEPPS	P55786	919 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	CTXN1	P60606	82 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	RHD	Q02161	417 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	SURF1	Q15526	300 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	SARG	Q9BW04	601 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	F2RL2	O00254	374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	FOXS1	O43638	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	PLAT	P00750	562 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	TYR	P14679	529 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	IL2RB	P14784	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	SLC6A4	P31645	630 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	CTSW	P56202	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	RAB1A	P62820	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	FOXL1	Q12952	345 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	XYLT1	Q86Y38	959 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	POLH	Q9Y253	713 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909		A0A088AWK7	358 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	APAF1	O14727	1248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	RAD17	O75943	681 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	RAP2A	P10114	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	PLS1	Q14651	629 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	GRM7	Q14831	915 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	DOK3	Q7L591	496 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MCCC1-208	ENST00000489909	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms