RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489527.1

GTPBP1-213, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-213	ENST00000489527	KANK3	Q6NY19	840 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	TMC7	Q7Z402	723 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	GPBP1	Q86WP2	473 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	KSR1	Q8IVT5	923 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	CD302	Q8IX05	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	RAD54L	Q92698	747 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	VWCE	Q96DN2	955 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	UROC1	Q96N76	676 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	TMX1	Q9H3N1	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	FZD8	Q9H461	694 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	TMEM206	Q9H813	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	ANO10	Q9NW15	660 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZBTB39	O15060	712 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	TSPAN1	O60635	241 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	TADA2A	O75478	443 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	TOM1L1	O75674	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	FGF18	O76093	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	MCF2	P10911	925 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	FGFR1	P11362	822 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	FGFR4	P22455	802 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	CDC25A	P30304	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	NPTX2	P47972	431 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	LIG4	P49917	911 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZNF75D	P51815	510 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZP2	Q05996	745 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	GRIK3	Q13003	919 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	REST	Q13127	1097 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	DRP2	Q13474	957 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	CES5A	Q6NT32	575 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	USP37	Q86T82	979 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	GPR65	Q8IYL9	337 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	CASD1	Q96PB1	797 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	PLIN2	Q99541	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	TLE6	Q9H808	572 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP1-213	ENST00000489527	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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