RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 DAAM2Q86T65 1068 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 STON2Q8WXE9 905 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 BORCS6Q96GS4 357 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 FAM167AQ96KS9 214 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 C20orf173Q96LM9 149 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 SARGQ9BW04 601 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 A6NNZ2 444 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 PLIN1O60240 522 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 ZBED1O96006 694 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 TRIM27P14373 513 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 FPR1P21462 350 aa6.29□□□□□ -1.4
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CCL20-204ENST00000489160 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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CCL20-204ENST00000489160 CTSWP56202 376 aa6.29□□□□□ -1.4
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CCL20-204ENST00000489160 PTH1RQ03431 593 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 DUSP8Q13202 625 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 GALEQ14376 348 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 ATP2B3Q16720 1220 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 MAP9Q49MG5 647 aa6.29□□□□□ -1.4
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CCL20-204ENST00000489160 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 KSR2Q6VAB6 950 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 CEP95Q96GE4 821 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 EPC1Q9H2F5 836 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 ZMYM3Q14202 1370 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 ZNF536O15090 1300 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 B5MCH6 92 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 TPP1O14773 563 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 PLATP00750 562 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 MALP21145 153 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 SMARCA1P28370 1054 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 ALDH1A3P47895 512 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 AFMIDQ63HM1 303 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 NPNTQ6UXI9 565 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 CXorf38Q8TB03 319 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 PTPN18Q99952 460 aa6.28□□□□□ -1.4
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CCL20-204ENST00000489160 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-204ENST00000489160 A0A088AWK7 358 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 CAPN8A6NHC0 703 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 PJA2O43164 708 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 RAP2AP10114 183 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 RHCEP18577 417 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 GPSM2P81274 684 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 RHDQ02161 417 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 SNAPC2Q13487 334 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 GRM7Q14831 915 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 LLGL1Q15334 1064 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 MFSD5Q6N075 450 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 OR14A2Q96R54 314 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 KCNH6Q9H252 994 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 WDCPQ9H6R7 721 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 L1RE1Q9UN81 338 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 H3BUI4 141 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 WNT10BO00744 389 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 RAD17O75943 681 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 STC2O76061 302 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 TYRP14679 529 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL20-204ENST00000489160 PHKG2P15735 406 aa6.26□□□□□ -1.41
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