RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CYP26A1O43174 497 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SEPT4O43236 478 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 PRPSAP2O60256 369 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 AKAP3O75969 853 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 MMP3P08254 477 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 CASP4P49662 377 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 PTPROQ16827 1216 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SLC35G1Q2M3R5 365 aa8.84□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 DPP3Q9NY33 737 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 OR1G1P47890 313 aa8.84□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 WDR49Q8IV35 697 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 DYDC1Q8WWB3 177 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 RSAD2Q8WXG1 361 aa8.84□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 AGPAT1Q99943 283 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 C11orf70Q9BRQ4 267 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM62Q9BVG3 475 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 RAB17Q9H0T7 212 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 MYH13Q9UKX3 1938 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 ITGB3P05106 788 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 RAG1P15918 1043 aa8.84□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 ARL4AP40617 200 aa8.84□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 ELMOD1Q8N336 334 aa8.84□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.84□□□□□ -0.99
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PTPRD-211ENST00000486161 AAASQ9NRG9 546 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 RNF14Q9UBS8 474 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 BCORQ6W2J9 1755 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-211ENST00000486161 GHRP10912 638 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 GLRA2P23416 452 aa8.83□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 CDKAL1Q5VV42 579 aa8.83□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.83□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 M0R2N6 131 aa8.83□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 PSMA2P25787 234 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 ADORA2BP29275 332 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 GTF2BQ00403 316 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 PRKCZQ05513 592 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 UGCGQ16739 394 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 NAA35Q5VZE5 725 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 CREBZFQ9NS37 354 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 TXNDC16Q9P2K2 825 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 MOCS3O95396 460 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 THP07101 528 aa8.83□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 OTUD6BQ8N6M0 293 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 PPP2R3CQ969Q6 453 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 LY75O60449 1722 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 RPTORQ8N122 1335 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 GPR25O00155 361 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 HSPA6P17066 643 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 TERF1P54274 439 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.83□□□□□ -1
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