RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM39BQ9GZU3 492 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 THAP2Q9H0W7 228 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD63C9JTQ0 380 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6V1C1P21283 382 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ATP5DP30049 168 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 IL9RQ01113 521 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGEF26Q96DR7 871 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PICK1Q9NRD5 415 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CYP39A1Q9NYL5 469 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PFASO15067 1338 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 MAPK13O15264 365 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PON1P27169 355 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ADCY8P40145 1251 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CACNA2D1P54289 1103 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP157Q5JU67 520 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 NSMFQ6X4W1 530 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 LENG9Q96B70 501 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 GORASP1Q9BQQ3 440 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 EPB41L4BQ9H329 900 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 RHBDL2Q9NX52 303 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 STOML1Q9UBI4 398 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PARP2Q9UGN5 583 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP69A5D8W1 941 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD62A6NC57 917 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM49P0CI25 452 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM49CP0CI26 452 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 TPBGLP0DKB5 382 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 GALNT15Q8N3T1 639 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 RUNDC3BQ96NL0 473 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ALG6Q9Y672 507 aa17.28■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 FAM187AA6NFU0 413 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 YDJCA8MPS7 323 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 GAS7O60861 476 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 RNF8O76064 485 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 NR3C1P04150 777 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 DLATP10515 647 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SPIRE1Q08AE8 756 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ZDHHC24Q6UX98 284 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 C4orf33Q8N1A6 199 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ABCB11O95342 1321 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PASKQ96RG2 1323 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CAPN9O14815 690 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SORBS3O60504 671 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PEX11AO75192 247 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 RPA1P27694 616 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 HOXD13P35453 343 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 STRN3Q13033 797 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SNX30Q5VWJ9 437 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PRUNE1Q86TP1 453 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 MAIP1Q8WWC4 291 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 KIFAP3Q92845 792 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 BTBD6Q96KE9 485 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 GANQ9H2C0 597 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PCIF1Q9H4Z3 704 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 TAS2R14Q9NYV8 317 aa17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 MYH4Q9Y623 1939 aa17.27■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0G2JND7 137 aa17.27■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa17.27■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PFDN1O60925 122 aa17.27■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 OVGP1Q12889 678 aa17.27■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 MPP2Q14168 576 aa17.27■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC36Q1X8D7 754 aa17.27■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 HHATQ5VTY9 493 aa17.27■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 HS2ST1Q7LGA3 356 aa17.27■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 RFFLQ8WZ73 363 aa17.27■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 WDR18Q9BV38 432 aa17.27■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM165Q9HC07 324 aa17.27■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CREB3O43889 395 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 OPHN1O60890 802 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ALADP13716 330 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 AP3B2Q13367 1082 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ISLR2Q6UXK2 745 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM74Q86UV6 250 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM73Q86UV7 250 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 LARGE2Q8N3Y3 721 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC77Q9BR77 488 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 NMRK1Q9NWW6 199 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 SERPINA10Q9UK55 444 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 GM2AP17900 193 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 CDR2Q01850 454 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 DEUP1Q05D60 604 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 DCAF12L1Q5VU92 463 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 ELMO3Q96BJ8 720 aa17.26■□□□□ 0.35
CCSAP-204ENST00000483092 NPHS2Q9NP85 383 aa17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms