RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		11.77	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	KLK14	Q9P0G3	267 aa		11.77	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	VAV3	Q9UKW4	847 aa		11.77	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		11.77	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		11.77	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	NPTXR	O95502	500 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	TUSC3	Q13454	348 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	TFDP1	Q14186	410 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	CSRP2	Q16527	193 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	XKR9	Q5GH70	373 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279		Q6ZUG5	572 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	HASPIN	Q8TF76	798 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ING5	Q8WYH8	240 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	BRF1	Q92994	677 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	MTR	Q99707	1265 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	LXN	Q9BS40	222 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	PARP2	Q9UGN5	583 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ZZEF1	O43149	2961 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279		A0A1B0GUA9	196 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279		M0R2N6	131 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	SLC37A4	O43826	429 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	KIF4A	O95239	1232 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	CPA1	P15085	419 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	OR1D2	P34982	312 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	CCR3	P51677	355 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	EPHA7	Q15375	998 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	POTEH	Q6S545	545 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	BLID	Q8IZY5	108 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	FAM20A	Q96MK3	541 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	BRD9	Q9H8M2	597 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	RGL1	Q9NZL6	768 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	VWA8	A3KMH1	1905 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ZBTB39	O15060	712 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	B4GALT5	O43286	388 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	GDF9	O60383	454 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	RHO	P08100	348 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	CXCL12	P48061	93 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	DMWD	Q09019	674 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	CAPS	Q13938	189 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	FBXL16	Q8N461	479 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	IRF7	Q92985	503 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	MTRR	Q9UBK8	725 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ARID2	Q68CP9	1835 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	PTGES	O14684	152 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	HR	O43593	1189 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	TH	P07101	528 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	CEBPB	P17676	345 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	PTPN2	P17706	415 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	KCNA4	P22459	653 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	FGFR3	P22607	806 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	FCAR	P24071	287 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	PML	P29590	882 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	CNR2	P34972	360 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ARL2	P36404	184 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	INF2	Q27J81	1249 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	GALNT17	Q6IS24	598 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	FAM3C	Q92520	227 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	DYDC2	Q96IM9	177 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	TBX3	O15119	743 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	DGAT1	O75907	488 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	CHRNB1	P11230	501 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	GLRA2	P23416	452 aa		11.72	□□□□□ -0.53
APTX-222	ENST00000478279	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53

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