RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.14□□□□□ -1.43
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PRPF40A-208ENST00000472760 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-208ENST00000472760 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-208ENST00000472760 WDCPQ9H6R7 721 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-208ENST00000472760 L1RE1Q9UN81 338 aa6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-208ENST00000472760 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PRPF40A-208ENST00000472760 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-208ENST00000472760 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-208ENST00000472760 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PRPF40A-208ENST00000472760 GRM6O15303 877 aa6.1□□□□□ -1.43
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