RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 FNIP1Q8TF40 1166 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 POF1BQ8WVV4 589 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 AJUBAQ96IF1 538 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 SIGLEC10Q96LC7 697 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 CARD11Q9BXL7 1154 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 STARD7Q9NQZ5 370 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 ING3Q9NXR8 418 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 OGDHLQ9ULD0 1010 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM184BQ9ULE4 1060 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF114Q9Y508 228 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 TEX33O43247 280 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 TOX4O94842 621 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 JUNP05412 331 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 KITP10721 976 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 IL2RBP14784 551 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 BRAFP15056 766 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 NPR1P16066 1061 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC7A1P30825 629 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 DLG4P78352 724 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF543Q08ER8 600 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 CNGA2Q16280 664 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 MLANAQ16655 118 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM95Q3KNT9 176 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 AGBL4Q5VU57 503 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 IZUMO3Q5VZ72 239 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 SKAP1Q86WV1 359 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 SUCLG2Q96I99 432 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 MRGPRX1Q96LB2 322 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 HERPUD2Q9BSE4 406 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 OR10A2Q9H208 303 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 LDAHQ9H6V9 325 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 CERS4Q9HA82 394 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNK12Q9HB15 430 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF287Q9HBT7 754 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 PNPLA8Q9NP80 782 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 JADE2Q9NQC1 790 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 GPRC5BQ9NZH0 403 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 NTMQ9P121 344 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 CPA4Q9UI42 421 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 LRCH1Q9Y2L9 728 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC189A1A4V9 331 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC10BA6NIK2 292 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 TBX3O15119 743 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 TSHRP16473 764 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 TYRP1P17643 537 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 EN2P19622 333 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 PCSK1P29120 753 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 PRDX5P30044 214 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 CSF2RBP32927 897 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 PTPN7P35236 360 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 STT3AP46977 705 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 CAP1Q01518 475 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 DAG1Q14118 895 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP2B3Q16720 1220 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 GAGE13Q4V321 117 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 ZMAT1Q5H9K5 638 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 SAPCD2Q86UD0 394 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM90A1Q86YD7 464 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD42Q8N9B4 389 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 MSLNLQ96KJ4 702 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 CRB3Q9BUF7 120 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM168Q9H0V1 697 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 VPS11Q9H270 941 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC6A15Q9H2J7 730 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 IRAK3Q9Y616 596 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 USP19O94966 1318 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 POM121BA6NF01 834 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 BTBD11A6QL63 1104 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 F2RL2O00254 374 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 NCK2O43639 380 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 NBNO60934 754 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 IL18RAPO95256 599 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 CD1AP06126 327 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 ABCB4P21439 1286 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 FPR1P21462 350 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 HALP42357 657 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-207ENST00000470201 RRADP55042 308 aa5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms