RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470095.5

HPS1-209, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-209ENST00000470095 IPPQ9Y573 584 aa15.43■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 TET1Q8NFU7 2136 aa15.43■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 TTC26A0AVF1 554 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 P4HA2O15460 535 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 STX10O60499 249 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 IL18RAPO95256 599 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 CLTBP09497 229 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 GTF2H1P32780 548 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 MXI1P50539 228 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 SURF1Q15526 300 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 DRC7Q8IY82 874 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 EFCAB13Q8IY85 973 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 SNX27Q96L92 541 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 ACAP3Q96P50 834 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 FNBP1Q96RU3 617 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 CRACR2AQ9BSW2 395 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 TRAIPQ9BWF2 469 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 TMEM8AQ9HCN3 771 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 SNTG2Q9NY99 539 aa15.42■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 LACTBL1A8MY62 500 aa15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 RECQL4O94761 1208 aa15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 CYP2C18P33260 490 aa15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 EPC2Q52LR7 807 aa15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 SV2AQ7L0J3 742 aa15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 WDR49Q8IV35 697 aa15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 OR5B17Q8NGF7 314 aa15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 LMO3Q8TAP4 145 aa15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 LINC01599Q8WXQ3 324 aa15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 FAM212AQ96EL1 285 aa15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 TTYH3Q9C0H2 523 aa15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 CXCL16Q9H2A7 254 aa15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 FAM105AQ9NUU6 356 aa15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 GCNT4Q9P109 453 aa15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 COQ4Q9Y3A0 265 aa15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa15.41■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 EPHB6O15197 1021 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 CXCL10P02778 98 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 GYPCP04921 128 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 NFICP08651 508 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 SLC9A1P19634 815 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 PON1P27169 355 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 CCL23P55773 120 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 EXOC3L4Q17RC7 722 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 TCTN1Q2MV58 587 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 ZACNQ401N2 412 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 KRT39Q6A163 491 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 JADE1Q6IE81 842 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 ALKAL1Q6UXT8 129 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 GBP6Q6ZN66 633 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 SCLYQ96I15 445 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 ADAM2Q99965 735 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 APOL6Q9BWW8 343 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 GANQ9H2C0 597 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 RNF39Q9H2S5 420 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 ASB7Q9H672 318 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 SIX2Q9NPC8 291 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 TMEM39AQ9NV64 488 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 IMPACTQ9P2X3 320 aa15.4■□□□□ 0.06
HPS1-209ENST00000470095 TRIM43BA6NCK2 446 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 KIAA0355O15063 1070 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 ZNF623O75123 536 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 LRRN2O75325 713 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 NOL4O94818 638 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 PARNO95453 639 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 VNN1O95497 513 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 ACTN1P12814 892 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 TNNI1P19237 187 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 AKAP5P24588 427 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 RAB27AP51159 221 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 APBA1Q02410 837 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 XKR4Q5GH76 650 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 FIGNQ5HY92 759 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 CD302Q8IX05 232 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 TAS1R2Q8TE23 839 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 SEMA4DQ92854 862 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 VWCEQ96DN2 955 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 PLCB1Q9NQ66 1216 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 RGS18Q9NS28 235 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 CNTN3Q9P232 1028 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 BRCA2P51587 3418 aa15.39■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 A0A0U1RQF3 1178 aa15.38■□□□□ 0.05
HPS1-209ENST00000470095 MEIS3P2A8K0S8 358 aa15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms