RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 H0Y858 1186 aa9.33□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 N4BP3O15049 544 aa9.33□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 PI15O43692 258 aa9.33□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 C1RP00736 705 aa9.33□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAPPC10P48553 1259 aa9.33□□□□□ -0.92
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GAPDHP28-201ENST00000455134 HDAC7Q8WUI4 952 aa9.33□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.33□□□□□ -0.92
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GAPDHP28-201ENST00000455134 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
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GAPDHP28-201ENST00000455134 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
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GAPDHP28-201ENST00000455134 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.32□□□□□ -0.92
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GAPDHP28-201ENST00000455134 CEP250Q9BV73 2442 aa9.32□□□□□ -0.92
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GAPDHP28-201ENST00000455134 PROB1E7EW31 1015 aa9.31□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANHXE9PGG2 379 aa9.31□□□□□ -0.92
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GAPDHP28-201ENST00000455134 AOC1P19801 751 aa9.31□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 FGFR3P22607 806 aa9.31□□□□□ -0.92
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GAPDHP28-201ENST00000455134 NUBP1P53384 320 aa9.31□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 NTHL1P78549 312 aa9.31□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 HTR4Q13639 388 aa9.31□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 PDIA5Q14554 519 aa9.31□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSMD5Q16401 504 aa9.31□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATF7IP2Q5U623 682 aa9.31□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM171A1Q5VUB5 890 aa9.31□□□□□ -0.92
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GAPDHP28-201ENST00000455134 ERMNQ8TAM6 284 aa9.31□□□□□ -0.92
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GAPDHP28-201ENST00000455134 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.31□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa9.31□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.31□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNFSF13BQ9Y275 285 aa9.31□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa9.31□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 I3L4J1 428 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 NR1I2O75469 434 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 TADA2AO75478 443 aa9.3□□□□□ -0.92
GAPDHP28-201ENST00000455134 LAMP2P13473 410 aa9.3□□□□□ -0.92
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