RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 IQCEQ6IPM2 695 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM228AQ86W67 206 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 NME8Q8N427 588 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 KAT5Q92993 513 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 DESI2Q9BSY9 194 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.64■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.64■■□□□ 1.22
SH3BP2-204ENST00000452765 A0A1W2PQJ5 194 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 KRT39Q6A163 491 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 CEP72Q9P209 647 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 CITO14578 2027 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 KBTBD13C9JR72 458 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 CDC42EP1Q00587 391 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 A0A0U1RQJ8 604 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 CABYRO75952 493 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 PDXDC1Q6P996 788 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 APOL6Q9BWW8 343 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 LACTBL1A8MY62 500 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 VNN1O95497 513 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 CLDN10P78369 228 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 BIRC3Q13489 604 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 TATDN2Q93075 761 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 SNTG2Q9NY99 539 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 STX10O60499 249 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 MCF2P10911 925 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 MGAT3Q09327 533 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 RNF39Q9H2S5 420 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 PHF24Q9UPV7 400 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM170AA1A519 330 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 M0QZ92 97 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 GHRP10912 638 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 AKAP5P24588 427 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 CGRRF1Q99675 332 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 NFICP08651 508 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 ZACNQ401N2 412 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 NOTUMQ6P988 496 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 RSPH3Q86UC2 560 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC51Q96ER9 411 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 RAB20Q9NX57 234 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 GUCY2FP51841 1108 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 RPS6KA5O75582 802 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 HLA-DRAP01903 254 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 UBXN11Q5T124 520 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 JADE1Q6IE81 842 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 SPAG5Q96R06 1193 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 GPR88Q9GZN0 384 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 ARVCFO00192 962 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 DNM1LO00429 736 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 CLTAP09496 248 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-204ENST00000452765 FECHP22830 423 aa22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms