RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	DMAC2	Q9NW81	257 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	MIOS	Q9NXC5	875 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		14.89	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	TH	P07101	528 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	PBX2	P40425	430 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYBPC2	Q14324	1141 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	NFIL3	Q16649	462 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	TTI2	Q6NXR4	508 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	FIBCD1	Q8N539	461 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNX27	Q96L92	541 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	MSRA	Q9UJ68	235 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	PTPRS	Q13332	1948 aa		14.88	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402		A0A1W2PPC1	479 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	TTC26	A0AVF1	554 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	LCHN	A4D1U4	455 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	AKAP3	O75969	853 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIF12	Q96FN5	646 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	FBXL18	Q96ME1	805 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	FNBP1	Q96RU3	617 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	PBX4	Q9BYU1	374 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	CNTN3	Q9P232	1028 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	LAMA3	Q16787	3333 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	PTGES	O14684	152 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	IL18RAP	O95256	599 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	CA3	P07451	260 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADRB2	P07550	413 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYP24A1	Q07973	514 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	JADE1	Q6IE81	842 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	CD302	Q8IX05	232 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRRC43	Q8N309	656 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	HCST	Q9UBK5	93 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		14.87	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	14.86	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRT13	P13646	458 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	TNNI1	P19237	187 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRIK3	Q13003	919 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAB30	Q15771	203 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	MED15	Q96RN5	788 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	ASB7	Q9H672	318 aa		14.86	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	DDHD2	O94830	711 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	NFIC	P08651	508 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNE1	P15382	129 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	WNT7B	P56706	349 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	SURF1	Q15526	300 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	XKR4	Q5GH76	650 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	RABGGTA	Q92696	567 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	CEP63	Q96MT8	703 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		14.85	□□□□□ -0.03
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		14.85	□□□□□ -0.03

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