RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ACVR2BQ13705 512 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL24Q5JXM2 366 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RELL1Q8IUW5 271 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CLMNQ96JQ2 1002 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 IL4RP24394 825 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPINB3P29508 390 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXN2P32314 431 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL21P46778 160 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RASSF2P50749 326 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC34A1Q06495 639 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ACSBG2Q5FVE4 666 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ODR4Q5SWX8 454 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PODNQ7Z5L7 613 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA24Q86W54 205 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 GRHL1Q9NZI5 618 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 GSG1L2A8MUP6 293 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM22K7EJ46 135 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPK13O15264 365 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RBP3P10745 1247 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF24P17028 368 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TAC1P20366 129 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SCNN1AP37088 669 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ERFP50548 548 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TMED1Q13445 227 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC41Q15345 812 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 FXNQ16595 210 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 EXOC3L4Q17RC7 722 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PCGF5Q86SE9 256 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CABP7Q86V35 215 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MYO1HQ8N1T3 1032 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEB6Q8N7X4 407 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 C18orf8Q96DM3 657 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 VMP1Q96GC9 406 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MPP4Q96JB8 637 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TBK1Q9UHD2 729 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ITM2BQ9Y287 266 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PASKQ96RG2 1323 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0J9YVX5 310 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MINDY4BA8MYZ0 360 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PLCG2P16885 1265 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK7P50613 346 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CDR2Q01850 454 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 AP1B1Q10567 949 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC3Q13217 504 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP7Q14244 749 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RASA3Q14644 834 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MFSD5Q6N075 450 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC55Q6ZSA7 311 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 DYMQ7RTS9 669 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEB18Q96M61 343 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MIPEPQ99797 713 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT82Q9NSB4 513 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PGAP2Q9UHJ9 254 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM221A6NGB7 291 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 GLTPD2A6NH11 291 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMG1O95456 288 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 VAV1P15498 845 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms