RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419303.5

PRAMENP-202, Transcript of PRAME N-terminal-like, pseudogene, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRAMENP, Length 1,869 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMENP-202ENST00000419303 MSH4O15457 936 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 FLT3LGP49771 235 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 NCALDP61601 193 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PRKCZQ05513 592 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 LRRC63Q05C16 580 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 TAPT1Q6NXT6 567 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 CCDC62Q6P9F0 684 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 SEC14L1Q92503 715 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 KCNH7Q9NS40 1196 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 GABRQQ9UN88 632 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PP2D1A8MPX8 630 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 CAND2O75155 1236 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PSMD10O75832 226 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 AP1G2O75843 785 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 AGTP01019 485 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 NUDT17P0C025 328 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 LINGO3P0C6S8 592 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 RARAP10276 462 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 KCNA2P16389 499 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PLCG1P19174 1290 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ATP4AP20648 1035 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 GBP1P32455 592 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ZNF76P36508 570 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 FLT3P36888 993 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 RAB27AP51159 221 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PDE6CP51160 858 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 RPS6KA3P51812 740 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 COPS2P61201 443 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 KCNJ2P63252 427 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 UBXN2AP68543 259 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 NKX3-2P78367 333 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 MTMR1Q13613 665 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PDIA5Q14554 519 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 TAF11Q15544 211 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PPP2R5EQ16537 467 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 CALCRLQ16602 461 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 GALNTL6Q49A17 601 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PRR16Q569H4 304 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 C6orf118Q5T5N4 469 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 LMNTD2Q8IXW0 634 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 CYP2W1Q8TAV3 490 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ITFG2Q969R8 447 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 KLHL29Q96CT2 875 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 TSC22D3Q99576 134 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 TBC1D22BQ9NU19 505 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 FLRT1Q9NZU1 646 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 LRRD1A4D1F6 860 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 DHX15O43143 795 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 SUN1O94901 812 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 UBOX5O94941 541 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ARP10275 920 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 SPIRE1Q08AE8 756 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 PPP2R5CQ13362 524 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ASIC2Q16515 512 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 FOXR2Q6PJQ5 311 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 OTOP1Q7RTM1 612 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 RDM1Q8NG50 284 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 FMO2Q99518 471 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 AP1M1Q9BXS5 423 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 WDR11Q9BZH6 1224 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 TRIM7Q9C029 511 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 NLRC4Q9NPP4 1024 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 VAV3Q9UKW4 847 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 AGAP1Q9UPQ3 857 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 STK24Q9Y6E0 443 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 SMCHD1A6NHR9 2005 aa11.4□□□□□ -0.58
PRAMENP-202ENST00000419303 E7ENQ6 273 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAMENP-202ENST00000419303 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.59
PRAMENP-202ENST00000419303 HIP1RO75146 1068 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAMENP-202ENST00000419303 MSH2P43246 934 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAMENP-202ENST00000419303 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
PRAMENP-202ENST00000419303 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
PRAMENP-202ENST00000419303 BNIP1Q12981 228 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAMENP-202ENST00000419303 ACVR2BQ13705 512 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAMENP-202ENST00000419303 DENND2CQ68D51 928 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAMENP-202ENST00000419303 IQSEC1Q6DN90 963 aa11.4□□□□□ -0.59
PRAMENP-202ENST00000419303 RASGEF1CQ8N431 466 aa11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms