RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM130Q8N3G9 435 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CEP120Q8N960 986 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 ITFG1Q8TB96 612 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 STAMQ92783 540 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 FOXQ1Q9C009 403 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 GDAQ9Y2T3 454 aa14.68□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 I3L4J1 428 aa14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 ACKR2O00590 384 aa14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CCL16O15467 120 aa14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 NR1I2O75469 434 aa14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 LIG1P18858 919 aa14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 RPA1P27694 616 aa14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 PSMD5Q16401 504 aa14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CEP57Q86XR8 500 aa14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 HACE1Q8IYU2 909 aa14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 ADSSL1Q8N142 457 aa14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 NACC1Q96RE7 527 aa14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 PIDD1Q9HB75 910 aa14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 R4GN57 208 aa14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.67□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CEP250Q9BV73 2442 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 N4BP3O15049 544 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 THP07101 528 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 C8AP07357 584 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 OR52Z1P0C646 297 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 FGFR3P22607 806 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 FSHRP23945 695 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 GPC5P78333 572 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 SPECC1Q5M775 1068 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 DAW1Q8N136 415 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 FGF13Q92913 245 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 DPP7Q9UHL4 492 aa14.66□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 SHISA7A6NL88 538 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 PP2D1A8MPX8 630 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 ABLIM1O14639 778 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 NAMPTP43490 491 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CLCNKBP51801 687 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 IL17AQ16552 155 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 MAPK6Q16659 721 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 SLC5A9Q2M3M2 681 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 NXPE3Q969Y0 559 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 CDH7Q9ULB5 785 aa14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CNGA3-202ENST00000393503 TRIP11Q15643 1979 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 OR1D2P34982 312 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 BRCC3P46736 316 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MAPK7Q13164 816 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 RAB33AQ14088 237 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 UPP1Q16831 310 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 TTC38Q5R3I4 469 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 KCNK18Q7Z418 384 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 KIF2CQ99661 725 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MTRRQ9UBK8 725 aa14.64□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 STK25O00506 426 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 HOXA9P31269 272 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 STARD6P59095 220 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 CREMQ03060 361 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 TRIM29Q14134 588 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 XKR4Q5GH76 650 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms