RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 FGFR4P22455 802 aa26.57■■□□□ 1.84
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ECHDC3-201ENST00000379215 MEA1Q16626 185 aa26.57■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 ZACNQ401N2 412 aa26.57■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa26.57■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 PDXDC1Q6P996 788 aa26.57■■□□□ 1.84
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ECHDC3-201ENST00000379215 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
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ECHDC3-201ENST00000379215 SIX2Q9NPC8 291 aa26.57■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 PLAGL2Q9UPG8 496 aa26.57■■□□□ 1.84
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ECHDC3-201ENST00000379215 RPS6KA5O75582 802 aa26.56■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 SEZ6Q53EL9 994 aa26.56■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM26DQ5JW98 314 aa26.56■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 USP38Q8NB14 1042 aa26.56■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 LMO3Q8TAP4 145 aa26.56■■□□□ 1.84
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ECHDC3-201ENST00000379215 RAB20Q9NX57 234 aa26.56■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 GPR182O15218 404 aa26.55■■□□□ 1.84
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ECHDC3-201ENST00000379215 FAM228AQ86W67 206 aa26.55■■□□□ 1.84
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ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF333Q96JL9 665 aa26.55■■□□□ 1.84
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ECHDC3-201ENST00000379215 MROH7Q68CQ1 1323 aa26.55■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 LRRC53A6NM62 1247 aa26.54■■□□□ 1.84
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ECHDC3-201ENST00000379215 CHRNA1P02708 482 aa26.54■■□□□ 1.84
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ECHDC3-201ENST00000379215 BIRC3Q13489 604 aa26.54■■□□□ 1.84
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ECHDC3-201ENST00000379215 NT5DC4Q86YG4 428 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 CEP120Q8N960 986 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
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ECHDC3-201ENST00000379215 FAM212AQ96EL1 285 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 STK33Q9BYT3 514 aa26.54■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 FHOD1Q9Y613 1164 aa26.54■■□□□ 1.84
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ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF516Q92618 1163 aa26.53■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 NT5C1BQ96P26 610 aa26.53■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa26.53■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 PHACTR2O75167 634 aa26.52■■□□□ 1.84
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ECHDC3-201ENST00000379215 PIK3CAP42336 1068 aa26.52■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 CDK7P50613 346 aa26.52■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 WNT7BP56706 349 aa26.52■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 WDR44Q5JSH3 913 aa26.52■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 IQCEQ6IPM2 695 aa26.52■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa26.52■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 TSPAN18Q96SJ8 248 aa26.52■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 AIPL1Q9NZN9 384 aa26.52■■□□□ 1.84
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC172P0C7W6 258 aa26.51■■□□□ 1.83
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ECHDC3-201ENST00000379215 C2CD2Q9Y426 696 aa26.51■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 SGPL1O95470 568 aa26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 STAT1P42224 750 aa26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 JAM2P57087 298 aa26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 FBXO47Q5MNV8 452 aa26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC170Q8IYT3 715 aa26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 TRPV6Q9H1D0 765 aa26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 KCND1Q9NSA2 647 aa26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 C1orf112Q9NSG2 853 aa26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 PTPRJQ12913 1337 aa26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 HLA-DRAP01903 254 aa26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
ECHDC3-201ENST00000379215 APBA1Q02410 837 aa26.5■■□□□ 1.83
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