RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC40A1Q9NP59 571 aa25.63■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 PDLIM7Q9NR12 457 aa25.63■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP39A1Q9NYL5 469 aa25.63■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 SORBS3O60504 671 aa25.63■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 DRD4P21917 467 aa25.63■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP6V0A1Q93050 837 aa25.63■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 CHMP6Q96FZ7 201 aa25.63■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 NCAPGQ9BPX3 1015 aa25.63■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa25.63■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 COPB2P35606 906 aa25.62■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 TCEAL1Q15170 157 aa25.62■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 KRT39Q6A163 491 aa25.62■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXL18Q96ME1 805 aa25.62■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM129AQ9BZQ8 928 aa25.62■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 ALG6Q9Y672 507 aa25.62■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 LCTP09848 1927 aa25.62■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 PHF2O75151 1096 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 GBP1P32455 592 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 DENND2CQ68D51 928 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 ZDHHC24Q6UX98 284 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC47A2Q86VL8 602 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 COQ4Q9Y3A0 265 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 DNM1LO00429 736 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP26A1O43174 497 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 SHBGP04278 402 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 CHRNA3P32297 505 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 PLTPP55058 493 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 TAX1BP1Q86VP1 789 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 UBL4BQ8N7F7 174 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 SHC3Q92529 594 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 ELMO3Q96BJ8 720 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 MFSD14AQ96MC6 490 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 TEX13BQ9BXU2 312 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 C17orf75Q9HAS0 396 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM8AQ9HCN3 771 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 C19orf81C9J6K1 198 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP2A1O14983 1001 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 CHUKO15111 745 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 PSAPP07602 524 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 PRKCEQ02156 737 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 HELQQ8TDG4 1101 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 TAS1R2Q8TE23 839 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 SNX24Q9Y343 169 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 PTGIRP43119 386 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 ACTR2P61160 394 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 ABHD15Q6UXT9 468 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 TAS1R3Q7RTX0 852 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 CROCCP2Q86T23 111 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 MDM1Q8TC05 714 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXO25Q8TCJ0 367 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 POMGNT1Q8WZA1 660 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 KLRG1Q96E93 195 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 ACAD9Q9H845 621 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 PCYOX1Q9UHG3 505 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 NFASCO94856 1347 aa25.6■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 RTN2O75298 545 aa25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 DGAT1O75907 488 aa25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 MMP13P45452 471 aa25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 GPC3P51654 580 aa25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 GSCP56915 257 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP26B1Q9NR63 512 aa25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 GRHL1Q9NZI5 618 aa25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 PARP2Q9UGN5 583 aa25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 PODXLO00592 558 aa25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 MFAP3P55082 362 aa25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 GPC5P78333 572 aa25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP24A1Q07973 514 aa25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 SPRED3Q2MJR0 410 aa25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 C18orf8Q96DM3 657 aa25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 KDM4CQ9H3R0 1056 aa25.59■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa25.58■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 GGPS1O95749 300 aa25.58■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 MMEP08473 750 aa25.58■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 GHRP10912 638 aa25.58■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 CTNNA2P26232 953 aa25.58■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 FMO1Q01740 532 aa25.58■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 SP2Q02086 613 aa25.58■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXL13Q8NEE6 735 aa25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms