RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 SRLQ86TD4 932 aa22.31■■□□□ 1.16
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SMURF1-201ENST00000361125 MCEEQ96PE7 176 aa22.27■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.27■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
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SMURF1-201ENST00000361125 PID1Q7Z2X4 250 aa22.27■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.27■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 POLLQ9UGP5 575 aa22.27■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 ADGRB1O14514 1584 aa22.27■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 E5RI56 91 aa22.27■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 SLC37A4O43826 429 aa22.27■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 BRAFP15056 766 aa22.27■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 RBP5P82980 135 aa22.27■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.27■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.27■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 ZFP69BQ9UJL9 534 aa22.27■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 ITSN1Q15811 1721 aa22.27■■□□□ 1.15
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