RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 BMPR1AP36894 532 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PBX2P40425 430 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 LMAN1P49257 510 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 FUT2Q10981 343 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SCFD1Q8WVM8 642 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC4DQ8WXI8 215 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC45Q96CN5 670 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM161AQ9NX61 479 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 COG5Q9UP83 839 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 NR2E1Q9Y466 385 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PITPNM1O00562 1244 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 NR2F2P24468 414 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 DEFB103AP81534 67 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 CRACR2AQ9BSW2 395 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TTPALQ9BTX7 342 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PHF20Q9BVI0 1012 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SEMA6BQ9H3T3 888 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 STK17AQ9UEE5 414 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GMEB2Q9UKD1 530 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 LAMA4Q16363 1823 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF263O14978 683 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 GJB5O95377 273 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 DARSP14868 501 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 PLD1Q13393 1074 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL40Q2TBA0 621 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SV2CQ496J9 727 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM240Q5SV17 173 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 DDX12PQ92771 950 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC114Q96M63 670 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1586Q9HCI6 787 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ANO10Q9NW15 660 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TIAM2Q8IVF5 1701 aa4.78□□□□□ -1.64
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PTPRC-201ENST00000348564 OR6B2Q6IFH4 312 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 PDXDC1Q6P996 788 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MIB1Q86YT6 1006 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 EPSTI1Q96J88 318 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ZFP14Q9HCL3 533 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 CDY1Q9Y6F8 540 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFS2O75306 463 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 YEATS4O95619 227 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 C8AP07357 584 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 CFHP08603 1231 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.652e-6■■■■□ 19.8
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PTPRC-201ENST00000348564 ALCAMQ13740 583 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GIT2Q14161 759 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 C10orf120Q5SQS8 335 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TRPV1Q8NER1 839 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 MFSD14AQ96MC6 490 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ZFP42Q96MM3 310 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SIK2Q9H0K1 926 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 NFASCO94856 1347 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 FSD2A1L4K1 749 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 MYMKA6NI61 221 aa4.77□□□□□ -1.65
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