RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ACKR2O00590 384 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TREHO43280 583 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 IQCF3P0C7M6 154 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TRIM49P0CI25 452 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TRIM49CP0CI26 452 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 RRM1P23921 792 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 FMO5P49326 533 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CYP24A1Q07973 514 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CCDC112Q8NEF3 446 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TRIM17Q9Y577 477 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.55□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 A0A0B4J269 797 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TULP2O00295 520 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 EPHB6O15197 1021 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 B4GALT5O43286 388 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GPR32O75388 356 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ASGR1P07306 291 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GRK4P32298 578 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CDC42EP1Q00587 391 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 C1orf220Q5T0J3 134 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TMEM139Q8IV31 216 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 NEK11Q8NG66 645 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TMC2Q8TDI7 906 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SCLT1Q96NL6 688 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CRACR2AQ9BSW2 395 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ZNF233A6NK53 670 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ABLIM1O14639 778 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CLDN3O15551 220 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 STX10O60499 249 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TOM1L1O75674 476 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PROZP22891 400 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SESN3P58005 492 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MYL7Q01449 175 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ENPEPQ07075 957 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 AMHR2Q16671 573 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CBWD6Q4V339 395 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ZNF394Q53GI3 561 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CBWD3Q5JTY5 395 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GBP6Q6ZN66 633 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ZBTB33Q86T24 672 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 C17orf50Q8WW18 174 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 DNAJB3Q8WWF6 145 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 DNAJC7Q99615 494 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 NOL4O94818 638 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PON1P27169 355 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 KRT9P35527 623 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ZBED6P86452 979 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MCL1Q07820 350 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GPS2Q13227 327 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 KIZQ2M2Z5 673 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 HHATQ5VTY9 493 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 RNF180Q86T96 592 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GCNT4Q9P109 453 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CEP72Q9P209 647 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.54□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 FAM189A1O60320 539 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SLC9A1P19634 815 aa6.53□□□□□ -1.36
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