RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 IFT81Q8WYA0 676 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 CAVIN3Q969G5 261 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 PHACTR2O75167 634 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 LGR5O75473 907 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 CALCAP01258 141 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 GJA5P36382 358 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 PIK3CAP42336 1068 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 BIRC3Q13489 604 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 WDR44Q5JSH3 913 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 ADAM21Q9UKJ8 722 aa24.58■■□□□ 1.53
SNX18-201ENST00000326277 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
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SNX18-201ENST00000326277 CCDC188H7C350 402 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 GRIN3BO60391 1043 aa24.57■■□□□ 1.52
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SNX18-201ENST00000326277 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
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SNX18-201ENST00000326277 MROH8Q9H579 483 aa24.57■■□□□ 1.52
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SNX18-201ENST00000326277 ZBTB42B2RXF5 422 aa24.57■■□□□ 1.52
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SNX18-201ENST00000326277 FGGP02679 453 aa24.57■■□□□ 1.52
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SNX18-201ENST00000326277 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
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SNX18-201ENST00000326277 ALG3Q92685 438 aa24.57■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 SPATA33Q96N06 139 aa24.57■■□□□ 1.52
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SNX18-201ENST00000326277 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa24.56■■□□□ 1.52
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SNX18-201ENST00000326277 CCDC62Q6P9F0 684 aa24.56■■□□□ 1.52
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SNX18-201ENST00000326277 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa24.55■■□□□ 1.52
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SNX18-201ENST00000326277 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.55■■□□□ 1.52
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SNX18-201ENST00000326277 CLDN3O15551 220 aa24.54■■□□□ 1.52
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SNX18-201ENST00000326277 CYP2C8P10632 490 aa24.54■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 CYP2C19P33261 490 aa24.54■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 SNAPC2Q13487 334 aa24.54■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa24.54■■□□□ 1.52
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SNX18-201ENST00000326277 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 TCP11Q8WWU5 503 aa24.54■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa24.54■■□□□ 1.52
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SNX18-201ENST00000326277 TXNP10599 105 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
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SNX18-201ENST00000326277 OR5B17Q8NGF7 314 aa24.54■■□□□ 1.52
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SNX18-201ENST00000326277 RPS6KC1Q96S38 1066 aa24.54■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 EFCC1Q9HA90 598 aa24.54■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 PDGFCQ9NRA1 345 aa24.54■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 TRPC6Q9Y210 931 aa24.54■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 NR2E1Q9Y466 385 aa24.54■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SNX18-201ENST00000326277 NAA35Q5VZE5 725 aa24.53■■□□□ 1.52
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