RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322060.9

PUS1-201, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene PUS1, Length 1,206 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-201ENST00000322060 PRKCBP05771 671 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-201ENST00000322060 RFX1P22670 979 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-201ENST00000322060 EFNA5P52803 228 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-201ENST00000322060 STARD6P59095 220 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-201ENST00000322060 RAB33AQ14088 237 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-201ENST00000322060 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
PUS1-201ENST00000322060 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-201ENST00000322060 LIN9Q5TKA1 542 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-201ENST00000322060 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PUS1-201ENST00000322060 BSNDQ8WZ55 320 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-201ENST00000322060 SHDQ96IW2 340 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-201ENST00000322060 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 C8AP07357 584 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 NEK4P51957 841 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 CEP57Q86XR8 500 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 DEPTORQ8TB45 409 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 HASPINQ8TF76 798 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 XYLBO75191 536 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 OR52Z1P0C646 297 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 FGFR3P22607 806 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 MTSS1LQ765P7 747 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 FGF13Q92913 245 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 ADAM12O43184 909 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 LMNAP02545 664 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 GPC5P78333 572 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 PARM1Q6UWI2 310 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 KIFAP3Q92845 792 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 FGF14Q92915 247 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 IFT74Q96LB3 600 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 UROC1Q96N76 676 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 MTRRQ9UBK8 725 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 KCNH3Q9ULD8 1083 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 EDN1P05305 212 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 DCNP07585 359 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 FOSBP53539 338 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 ST3GAL1Q11201 340 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 C1orf210Q8IVY1 113 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 PJA1Q8NG27 643 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 BORCS6Q96GS4 357 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 CCL16O15467 120 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 TRAPPC3O43617 180 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 B3GAT3O94766 335 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 OR1D2P34982 312 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 ID4P47928 161 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 TRAPPC10P48553 1259 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.871e-6■□□□□ 8.7
PUS1-201ENST00000322060 NTHL1P78549 312 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 ZNF174Q15697 407 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 UPP1Q16831 310 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 USP20Q9Y2K6 914 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 GDAQ9Y2T3 454 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 STK24Q9Y6E0 443 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 K7ERI5 159 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 SP9P0CG40 484 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 CLCNKBP51801 687 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 PFKPQ01813 784 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 GUCY1B3Q02153 619 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 PRKCQQ04759 706 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 PDIA5Q14554 519 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 XKR4Q5GH76 650 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 ITFG1Q8TB96 612 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 C8orf76Q96K31 380 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 SPTBN4Q9H254 2564 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-201ENST00000322060 DMDP11532 3685 aa20.45■□□□□ 0.86
PUS1-201ENST00000322060 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.45■□□□□ 0.86
PUS1-201ENST00000322060 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.45■□□□□ 0.86
PUS1-201ENST00000322060 GLULP15104 373 aa20.45■□□□□ 0.86
PUS1-201ENST00000322060 LIG1P18858 919 aa20.45■□□□□ 0.86
PUS1-201ENST00000322060 SPECC1Q5M775 1068 aa20.45■□□□□ 0.86
PUS1-201ENST00000322060 TTC38Q5R3I4 469 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms